Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Cacnb3P54285 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cacnb3P54285 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cacnb3P54285 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cacnb3P54285 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cacnb3P54285 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Cacnb3P54285 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cacnb3P54285 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cacnb3P54285 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cacnb3P54285 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cacnb3P54285 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cacnb3P54285 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cacnb3P54285 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cacnb3P54285 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cacnb3P54285 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cacnb3P54285 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cacnb3P54285 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cacnb3P54285 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cacnb3P54285 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cacnb3P54285 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cacnb3P54285 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cacnb3P54285 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Cacnb3P54285 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cacnb3P54285 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cacnb3P54285 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cacnb3P54285 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cacnb3P54285 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cacnb3P54285 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cacnb3P54285 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cacnb3P54285 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cacnb3P54285 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cacnb3P54285 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cacnb3P54285 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cacnb3P54285 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cacnb3P54285 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cacnb3P54285 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cacnb3P54285 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cacnb3P54285 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cacnb3P54285 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cacnb3P54285 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cacnb3P54285 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cacnb3P54285 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cacnb3P54285 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cacnb3P54285 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cacnb3P54285 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cacnb3P54285 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cacnb3P54285 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cacnb3P54285 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cacnb3P54285 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cacnb3P54285 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cacnb3P54285 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cacnb3P54285 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cacnb3P54285 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cacnb3P54285 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cacnb3P54285 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cacnb3P54285 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cacnb3P54285 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cacnb3P54285 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cacnb3P54285 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cacnb3P54285 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cacnb3P54285 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cacnb3P54285 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cacnb3P54285 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cacnb3P54285 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cacnb3P54285 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cacnb3P54285 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cacnb3P54285 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Cacnb3P54285 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cacnb3P54285 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cacnb3P54285 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cacnb3P54285 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cacnb3P54285 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cacnb3P54285 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cacnb3P54285 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cacnb3P54285 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cacnb3P54285 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cacnb3P54285 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cacnb3P54285 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cacnb3P54285 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Cacnb3P54285 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cacnb3P54285 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cacnb3P54285 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cacnb3P54285 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cacnb3P54285 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cacnb3P54285 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cacnb3P54285 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cacnb3P54285 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cacnb3P54285 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cacnb3P54285 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cacnb3P54285 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cacnb3P54285 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cacnb3P54285 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cacnb3P54285 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cacnb3P54285 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cacnb3P54285 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cacnb3P54285 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cacnb3P54285 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cacnb3P54285 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cacnb3P54285 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cacnb3P54285 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms