Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Map3k1P53349 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
Map3k1P53349 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Map3k1P53349 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Map3k1P53349 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Map3k1P53349 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Map3k1P53349 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Map3k1P53349 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Map3k1P53349 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Map3k1P53349 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Map3k1P53349 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Map3k1P53349 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Map3k1P53349 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Map3k1P53349 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Map3k1P53349 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Map3k1P53349 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Map3k1P53349 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Map3k1P53349 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Map3k1P53349 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Map3k1P53349 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Map3k1P53349 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Map3k1P53349 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Map3k1P53349 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Map3k1P53349 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Map3k1P53349 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Map3k1P53349 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Map3k1P53349 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Map3k1P53349 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Map3k1P53349 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Map3k1P53349 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Map3k1P53349 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Map3k1P53349 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Map3k1P53349 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Map3k1P53349 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Map3k1P53349 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Map3k1P53349 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Map3k1P53349 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Map3k1P53349 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
Map3k1P53349 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Map3k1P53349 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Map3k1P53349 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Map3k1P53349 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Map3k1P53349 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Map3k1P53349 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Map3k1P53349 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Map3k1P53349 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Map3k1P53349 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Map3k1P53349 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Map3k1P53349 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Map3k1P53349 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Map3k1P53349 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Map3k1P53349 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Map3k1P53349 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Map3k1P53349 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
Map3k1P53349 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Map3k1P53349 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Map3k1P53349 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Map3k1P53349 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Map3k1P53349 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Map3k1P53349 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Map3k1P53349 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Map3k1P53349 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Map3k1P53349 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Map3k1P53349 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Map3k1P53349 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Map3k1P53349 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Map3k1P53349 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Map3k1P53349 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Map3k1P53349 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Map3k1P53349 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Map3k1P53349 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Map3k1P53349 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Map3k1P53349 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Map3k1P53349 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Map3k1P53349 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Map3k1P53349 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Map3k1P53349 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Map3k1P53349 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Map3k1P53349 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Map3k1P53349 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Map3k1P53349 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Map3k1P53349 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Map3k1P53349 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Map3k1P53349 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Map3k1P53349 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
Map3k1P53349 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Map3k1P53349 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Map3k1P53349 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Map3k1P53349 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Map3k1P53349 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Map3k1P53349 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
Map3k1P53349 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Map3k1P53349 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Map3k1P53349 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Map3k1P53349 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Map3k1P53349 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Map3k1P53349 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Map3k1P53349 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Map3k1P53349 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Map3k1P53349 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms