Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptx3P48759 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptx3P48759 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptx3P48759 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ptx3P48759 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ptx3P48759 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ptx3P48759 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ptx3P48759 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ptx3P48759 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptx3P48759 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptx3P48759 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptx3P48759 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptx3P48759 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptx3P48759 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptx3P48759 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptx3P48759 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptx3P48759 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptx3P48759 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptx3P48759 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptx3P48759 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptx3P48759 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptx3P48759 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptx3P48759 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptx3P48759 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptx3P48759 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptx3P48759 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptx3P48759 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptx3P48759 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptx3P48759 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptx3P48759 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptx3P48759 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptx3P48759 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptx3P48759 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptx3P48759 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptx3P48759 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptx3P48759 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptx3P48759 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptx3P48759 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptx3P48759 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptx3P48759 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptx3P48759 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptx3P48759 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptx3P48759 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptx3P48759 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptx3P48759 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptx3P48759 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptx3P48759 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ptx3P48759 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ptx3P48759 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ptx3P48759 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ptx3P48759 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ptx3P48759 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ptx3P48759 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms