Protein–RNA interactions for Protein: P47774

Ccr7, C-C chemokine receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr7P47774 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccr7P47774 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccr7P47774 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccr7P47774 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccr7P47774 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccr7P47774 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccr7P47774 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccr7P47774 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccr7P47774 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccr7P47774 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccr7P47774 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccr7P47774 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccr7P47774 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccr7P47774 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccr7P47774 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccr7P47774 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccr7P47774 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccr7P47774 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccr7P47774 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccr7P47774 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccr7P47774 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccr7P47774 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccr7P47774 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccr7P47774 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccr7P47774 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccr7P47774 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccr7P47774 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccr7P47774 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccr7P47774 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccr7P47774 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccr7P47774 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccr7P47774 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccr7P47774 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccr7P47774 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccr7P47774 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccr7P47774 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccr7P47774 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccr7P47774 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccr7P47774 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccr7P47774 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccr7P47774 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccr7P47774 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccr7P47774 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccr7P47774 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccr7P47774 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccr7P47774 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccr7P47774 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccr7P47774 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccr7P47774 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccr7P47774 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccr7P47774 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccr7P47774 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccr7P47774 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccr7P47774 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccr7P47774 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccr7P47774 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccr7P47774 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccr7P47774 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccr7P47774 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccr7P47774 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccr7P47774 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccr7P47774 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccr7P47774 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccr7P47774 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccr7P47774 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccr7P47774 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccr7P47774 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccr7P47774 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccr7P47774 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccr7P47774 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccr7P47774 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccr7P47774 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccr7P47774 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccr7P47774 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccr7P47774 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccr7P47774 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccr7P47774 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccr7P47774 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccr7P47774 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccr7P47774 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccr7P47774 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccr7P47774 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccr7P47774 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccr7P47774 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccr7P47774 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccr7P47774 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccr7P47774 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccr7P47774 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccr7P47774 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccr7P47774 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccr7P47774 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccr7P47774 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccr7P47774 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccr7P47774 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccr7P47774 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccr7P47774 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccr7P47774 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccr7P47774 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccr7P47774 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccr7P47774 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms