Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VhlP40338 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VhlP40338 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
VhlP40338 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VhlP40338 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VhlP40338 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VhlP40338 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VhlP40338 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VhlP40338 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VhlP40338 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VhlP40338 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VhlP40338 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VhlP40338 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VhlP40338 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VhlP40338 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VhlP40338 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
VhlP40338 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VhlP40338 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VhlP40338 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VhlP40338 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VhlP40338 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VhlP40338 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VhlP40338 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VhlP40338 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VhlP40338 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VhlP40338 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VhlP40338 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VhlP40338 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VhlP40338 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VhlP40338 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VhlP40338 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VhlP40338 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VhlP40338 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VhlP40338 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VhlP40338 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VhlP40338 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VhlP40338 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VhlP40338 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VhlP40338 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VhlP40338 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VhlP40338 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VhlP40338 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VhlP40338 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VhlP40338 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VhlP40338 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VhlP40338 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VhlP40338 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VhlP40338 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VhlP40338 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VhlP40338 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VhlP40338 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VhlP40338 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VhlP40338 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VhlP40338 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VhlP40338 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VhlP40338 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VhlP40338 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VhlP40338 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VhlP40338 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VhlP40338 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VhlP40338 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VhlP40338 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VhlP40338 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VhlP40338 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VhlP40338 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VhlP40338 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VhlP40338 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VhlP40338 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VhlP40338 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VhlP40338 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VhlP40338 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VhlP40338 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VhlP40338 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VhlP40338 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VhlP40338 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VhlP40338 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VhlP40338 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VhlP40338 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VhlP40338 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VhlP40338 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VhlP40338 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VhlP40338 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VhlP40338 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VhlP40338 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VhlP40338 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VhlP40338 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VhlP40338 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VhlP40338 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VhlP40338 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VhlP40338 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VhlP40338 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VhlP40338 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VhlP40338 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VhlP40338 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VhlP40338 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VhlP40338 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VhlP40338 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VhlP40338 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
VhlP40338 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VhlP40338 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms