Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fen1P39749 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fen1P39749 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fen1P39749 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fen1P39749 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fen1P39749 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fen1P39749 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fen1P39749 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fen1P39749 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fen1P39749 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fen1P39749 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fen1P39749 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fen1P39749 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fen1P39749 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Fen1P39749 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fen1P39749 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fen1P39749 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fen1P39749 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Fen1P39749 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fen1P39749 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fen1P39749 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fen1P39749 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Fen1P39749 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fen1P39749 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fen1P39749 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fen1P39749 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fen1P39749 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fen1P39749 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fen1P39749 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fen1P39749 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fen1P39749 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fen1P39749 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fen1P39749 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fen1P39749 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fen1P39749 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fen1P39749 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fen1P39749 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fen1P39749 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fen1P39749 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Fen1P39749 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fen1P39749 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fen1P39749 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fen1P39749 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fen1P39749 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fen1P39749 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fen1P39749 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fen1P39749 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fen1P39749 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fen1P39749 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fen1P39749 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fen1P39749 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fen1P39749 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fen1P39749 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fen1P39749 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fen1P39749 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fen1P39749 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fen1P39749 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fen1P39749 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fen1P39749 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fen1P39749 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fen1P39749 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Fen1P39749 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fen1P39749 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fen1P39749 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fen1P39749 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fen1P39749 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fen1P39749 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fen1P39749 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fen1P39749 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Fen1P39749 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fen1P39749 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fen1P39749 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fen1P39749 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fen1P39749 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fen1P39749 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fen1P39749 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fen1P39749 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fen1P39749 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fen1P39749 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fen1P39749 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fen1P39749 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fen1P39749 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fen1P39749 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fen1P39749 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fen1P39749 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fen1P39749 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fen1P39749 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fen1P39749 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fen1P39749 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fen1P39749 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fen1P39749 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fen1P39749 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fen1P39749 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fen1P39749 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fen1P39749 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fen1P39749 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fen1P39749 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fen1P39749 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fen1P39749 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fen1P39749 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms