Protein–RNA interactions for Protein: P39447

Tjp1, Tight junction protein ZO-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tjp1P39447 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tjp1P39447 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tjp1P39447 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tjp1P39447 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tjp1P39447 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Tjp1P39447 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tjp1P39447 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tjp1P39447 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tjp1P39447 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tjp1P39447 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tjp1P39447 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tjp1P39447 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tjp1P39447 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tjp1P39447 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tjp1P39447 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Tjp1P39447 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Tjp1P39447 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tjp1P39447 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tjp1P39447 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tjp1P39447 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tjp1P39447 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tjp1P39447 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tjp1P39447 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tjp1P39447 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tjp1P39447 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tjp1P39447 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Tjp1P39447 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tjp1P39447 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tjp1P39447 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tjp1P39447 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tjp1P39447 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tjp1P39447 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tjp1P39447 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tjp1P39447 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tjp1P39447 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tjp1P39447 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tjp1P39447 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tjp1P39447 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tjp1P39447 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tjp1P39447 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tjp1P39447 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tjp1P39447 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tjp1P39447 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tjp1P39447 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tjp1P39447 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tjp1P39447 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tjp1P39447 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tjp1P39447 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tjp1P39447 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tjp1P39447 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tjp1P39447 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tjp1P39447 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tjp1P39447 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tjp1P39447 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tjp1P39447 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tjp1P39447 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tjp1P39447 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tjp1P39447 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Tjp1P39447 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Tjp1P39447 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tjp1P39447 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tjp1P39447 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Tjp1P39447 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tjp1P39447 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tjp1P39447 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tjp1P39447 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tjp1P39447 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tjp1P39447 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tjp1P39447 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tjp1P39447 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tjp1P39447 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tjp1P39447 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tjp1P39447 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tjp1P39447 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tjp1P39447 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tjp1P39447 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tjp1P39447 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tjp1P39447 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tjp1P39447 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tjp1P39447 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tjp1P39447 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tjp1P39447 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tjp1P39447 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tjp1P39447 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tjp1P39447 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tjp1P39447 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tjp1P39447 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tjp1P39447 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tjp1P39447 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tjp1P39447 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tjp1P39447 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tjp1P39447 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tjp1P39447 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tjp1P39447 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tjp1P39447 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tjp1P39447 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tjp1P39447 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tjp1P39447 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tjp1P39447 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tjp1P39447 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms