Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ly6dP35459 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ly6dP35459 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ly6dP35459 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ly6dP35459 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ly6dP35459 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ly6dP35459 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ly6dP35459 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ly6dP35459 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ly6dP35459 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ly6dP35459 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ly6dP35459 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ly6dP35459 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ly6dP35459 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ly6dP35459 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ly6dP35459 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ly6dP35459 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ly6dP35459 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ly6dP35459 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ly6dP35459 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ly6dP35459 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ly6dP35459 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ly6dP35459 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ly6dP35459 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ly6dP35459 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ly6dP35459 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ly6dP35459 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ly6dP35459 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ly6dP35459 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ly6dP35459 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ly6dP35459 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ly6dP35459 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ly6dP35459 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ly6dP35459 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ly6dP35459 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ly6dP35459 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ly6dP35459 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ly6dP35459 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ly6dP35459 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ly6dP35459 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ly6dP35459 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ly6dP35459 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ly6dP35459 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ly6dP35459 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ly6dP35459 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ly6dP35459 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ly6dP35459 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ly6dP35459 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ly6dP35459 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ly6dP35459 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ly6dP35459 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ly6dP35459 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ly6dP35459 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ly6dP35459 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ly6dP35459 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ly6dP35459 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ly6dP35459 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ly6dP35459 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ly6dP35459 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ly6dP35459 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ly6dP35459 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ly6dP35459 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ly6dP35459 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ly6dP35459 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ly6dP35459 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ly6dP35459 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ly6dP35459 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ly6dP35459 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ly6dP35459 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ly6dP35459 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ly6dP35459 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ly6dP35459 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ly6dP35459 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ly6dP35459 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ly6dP35459 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ly6dP35459 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ly6dP35459 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ly6dP35459 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ly6dP35459 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ly6dP35459 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ly6dP35459 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ly6dP35459 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ly6dP35459 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ly6dP35459 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ly6dP35459 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ly6dP35459 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ly6dP35459 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ly6dP35459 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ly6dP35459 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ly6dP35459 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ly6dP35459 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ly6dP35459 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ly6dP35459 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ly6dP35459 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ly6dP35459 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ly6dP35459 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ly6dP35459 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ly6dP35459 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ly6dP35459 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ly6dP35459 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms