Protein–RNA interactions for Protein: P32115

Pax4, Paired box protein Pax-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax4P32115 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pax4P32115 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pax4P32115 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pax4P32115 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pax4P32115 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pax4P32115 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pax4P32115 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pax4P32115 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pax4P32115 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pax4P32115 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pax4P32115 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pax4P32115 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pax4P32115 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pax4P32115 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pax4P32115 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pax4P32115 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pax4P32115 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pax4P32115 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pax4P32115 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pax4P32115 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pax4P32115 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pax4P32115 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pax4P32115 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pax4P32115 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pax4P32115 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pax4P32115 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pax4P32115 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pax4P32115 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pax4P32115 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pax4P32115 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pax4P32115 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pax4P32115 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pax4P32115 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pax4P32115 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pax4P32115 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pax4P32115 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pax4P32115 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pax4P32115 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pax4P32115 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pax4P32115 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pax4P32115 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pax4P32115 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pax4P32115 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pax4P32115 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pax4P32115 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pax4P32115 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pax4P32115 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pax4P32115 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pax4P32115 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pax4P32115 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pax4P32115 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pax4P32115 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pax4P32115 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pax4P32115 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pax4P32115 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pax4P32115 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pax4P32115 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pax4P32115 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Pax4P32115 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Pax4P32115 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pax4P32115 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pax4P32115 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pax4P32115 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pax4P32115 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pax4P32115 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pax4P32115 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pax4P32115 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pax4P32115 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pax4P32115 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pax4P32115 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pax4P32115 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pax4P32115 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pax4P32115 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pax4P32115 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pax4P32115 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pax4P32115 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pax4P32115 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pax4P32115 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pax4P32115 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pax4P32115 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pax4P32115 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pax4P32115 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pax4P32115 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pax4P32115 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pax4P32115 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pax4P32115 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pax4P32115 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pax4P32115 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pax4P32115 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pax4P32115 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pax4P32115 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pax4P32115 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pax4P32115 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pax4P32115 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pax4P32115 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pax4P32115 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pax4P32115 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pax4P32115 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pax4P32115 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pax4P32115 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms