Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxc10P31257 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxc10P31257 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxc10P31257 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxc10P31257 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxc10P31257 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxc10P31257 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxc10P31257 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxc10P31257 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxc10P31257 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxc10P31257 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxc10P31257 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxc10P31257 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxc10P31257 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxc10P31257 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxc10P31257 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxc10P31257 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxc10P31257 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxc10P31257 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxc10P31257 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxc10P31257 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxc10P31257 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxc10P31257 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxc10P31257 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxc10P31257 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxc10P31257 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxc10P31257 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxc10P31257 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxc10P31257 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxc10P31257 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxc10P31257 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxc10P31257 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxc10P31257 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxc10P31257 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxc10P31257 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxc10P31257 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxc10P31257 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxc10P31257 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxc10P31257 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxc10P31257 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxc10P31257 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxc10P31257 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxc10P31257 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxc10P31257 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxc10P31257 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxc10P31257 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxc10P31257 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxc10P31257 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxc10P31257 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxc10P31257 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hoxc10P31257 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hoxc10P31257 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxc10P31257 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxc10P31257 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxc10P31257 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxc10P31257 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxc10P31257 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxc10P31257 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxc10P31257 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxc10P31257 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxc10P31257 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxc10P31257 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxc10P31257 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxc10P31257 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxc10P31257 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxc10P31257 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxc10P31257 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxc10P31257 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxc10P31257 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hoxc10P31257 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hoxc10P31257 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hoxc10P31257 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxc10P31257 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxc10P31257 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxc10P31257 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxc10P31257 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxc10P31257 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxc10P31257 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxc10P31257 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxc10P31257 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxc10P31257 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxc10P31257 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxc10P31257 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxc10P31257 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxc10P31257 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxc10P31257 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxc10P31257 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxc10P31257 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxc10P31257 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxc10P31257 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxc10P31257 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxc10P31257 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxc10P31257 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxc10P31257 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxc10P31257 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxc10P31257 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxc10P31257 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxc10P31257 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxc10P31257 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxc10P31257 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms