Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tacr1P30548 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tacr1P30548 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tacr1P30548 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tacr1P30548 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tacr1P30548 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tacr1P30548 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tacr1P30548 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tacr1P30548 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tacr1P30548 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tacr1P30548 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tacr1P30548 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tacr1P30548 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tacr1P30548 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tacr1P30548 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tacr1P30548 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tacr1P30548 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tacr1P30548 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tacr1P30548 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tacr1P30548 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tacr1P30548 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tacr1P30548 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tacr1P30548 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tacr1P30548 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tacr1P30548 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tacr1P30548 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tacr1P30548 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tacr1P30548 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tacr1P30548 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tacr1P30548 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tacr1P30548 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tacr1P30548 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tacr1P30548 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tacr1P30548 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tacr1P30548 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tacr1P30548 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tacr1P30548 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tacr1P30548 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tacr1P30548 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tacr1P30548 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tacr1P30548 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tacr1P30548 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tacr1P30548 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tacr1P30548 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tacr1P30548 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tacr1P30548 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tacr1P30548 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tacr1P30548 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tacr1P30548 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tacr1P30548 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tacr1P30548 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tacr1P30548 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tacr1P30548 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tacr1P30548 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tacr1P30548 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tacr1P30548 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tacr1P30548 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tacr1P30548 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tacr1P30548 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tacr1P30548 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tacr1P30548 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tacr1P30548 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tacr1P30548 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tacr1P30548 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tacr1P30548 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tacr1P30548 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tacr1P30548 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tacr1P30548 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tacr1P30548 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tacr1P30548 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tacr1P30548 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tacr1P30548 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tacr1P30548 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tacr1P30548 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tacr1P30548 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tacr1P30548 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tacr1P30548 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tacr1P30548 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tacr1P30548 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tacr1P30548 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tacr1P30548 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tacr1P30548 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tacr1P30548 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tacr1P30548 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tacr1P30548 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tacr1P30548 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tacr1P30548 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tacr1P30548 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tacr1P30548 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tacr1P30548 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tacr1P30548 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tacr1P30548 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tacr1P30548 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tacr1P30548 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tacr1P30548 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tacr1P30548 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tacr1P30548 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tacr1P30548 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tacr1P30548 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tacr1P30548 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms