Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BgnP28653 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BgnP28653 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BgnP28653 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BgnP28653 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BgnP28653 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BgnP28653 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BgnP28653 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BgnP28653 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BgnP28653 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BgnP28653 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BgnP28653 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BgnP28653 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BgnP28653 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BgnP28653 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BgnP28653 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BgnP28653 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BgnP28653 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BgnP28653 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
BgnP28653 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
BgnP28653 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BgnP28653 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BgnP28653 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BgnP28653 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BgnP28653 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BgnP28653 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BgnP28653 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BgnP28653 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BgnP28653 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BgnP28653 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BgnP28653 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BgnP28653 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BgnP28653 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BgnP28653 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BgnP28653 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BgnP28653 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BgnP28653 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BgnP28653 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BgnP28653 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BgnP28653 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BgnP28653 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BgnP28653 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BgnP28653 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BgnP28653 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BgnP28653 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BgnP28653 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BgnP28653 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BgnP28653 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BgnP28653 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BgnP28653 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BgnP28653 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BgnP28653 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BgnP28653 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BgnP28653 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BgnP28653 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BgnP28653 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BgnP28653 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BgnP28653 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BgnP28653 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
BgnP28653 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BgnP28653 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BgnP28653 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BgnP28653 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BgnP28653 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BgnP28653 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BgnP28653 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BgnP28653 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BgnP28653 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BgnP28653 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BgnP28653 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BgnP28653 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BgnP28653 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BgnP28653 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BgnP28653 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BgnP28653 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BgnP28653 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BgnP28653 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BgnP28653 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BgnP28653 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BgnP28653 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BgnP28653 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BgnP28653 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BgnP28653 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BgnP28653 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BgnP28653 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BgnP28653 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BgnP28653 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BgnP28653 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BgnP28653 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BgnP28653 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BgnP28653 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BgnP28653 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BgnP28653 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BgnP28653 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BgnP28653 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BgnP28653 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BgnP28653 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BgnP28653 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BgnP28653 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BgnP28653 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms