Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnna1P26231 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctnna1P26231 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctnna1P26231 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctnna1P26231 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctnna1P26231 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctnna1P26231 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ctnna1P26231 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ctnna1P26231 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ctnna1P26231 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctnna1P26231 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctnna1P26231 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctnna1P26231 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctnna1P26231 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnna1P26231 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnna1P26231 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnna1P26231 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnna1P26231 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnna1P26231 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnna1P26231 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctnna1P26231 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctnna1P26231 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctnna1P26231 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctnna1P26231 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctnna1P26231 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctnna1P26231 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctnna1P26231 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctnna1P26231 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctnna1P26231 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctnna1P26231 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnna1P26231 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnna1P26231 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnna1P26231 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnna1P26231 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctnna1P26231 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctnna1P26231 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctnna1P26231 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctnna1P26231 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctnna1P26231 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctnna1P26231 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctnna1P26231 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctnna1P26231 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctnna1P26231 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctnna1P26231 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctnna1P26231 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnna1P26231 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnna1P26231 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnna1P26231 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnna1P26231 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnna1P26231 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnna1P26231 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnna1P26231 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnna1P26231 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnna1P26231 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnna1P26231 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnna1P26231 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctnna1P26231 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctnna1P26231 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctnna1P26231 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctnna1P26231 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctnna1P26231 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctnna1P26231 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctnna1P26231 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctnna1P26231 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctnna1P26231 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctnna1P26231 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctnna1P26231 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctnna1P26231 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctnna1P26231 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctnna1P26231 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctnna1P26231 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctnna1P26231 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctnna1P26231 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctnna1P26231 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnna1P26231 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnna1P26231 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnna1P26231 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnna1P26231 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnna1P26231 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnna1P26231 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnna1P26231 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnna1P26231 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnna1P26231 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnna1P26231 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnna1P26231 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctnna1P26231 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctnna1P26231 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctnna1P26231 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctnna1P26231 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctnna1P26231 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctnna1P26231 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctnna1P26231 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctnna1P26231 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctnna1P26231 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctnna1P26231 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctnna1P26231 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctnna1P26231 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctnna1P26231 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctnna1P26231 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctnna1P26231 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms