Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Hoxd11P23813 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hoxd11P23813 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hoxd11P23813 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hoxd11P23813 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hoxd11P23813 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Hoxd11P23813 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hoxd11P23813 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hoxd11P23813 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hoxd11P23813 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hoxd11P23813 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hoxd11P23813 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hoxd11P23813 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hoxd11P23813 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hoxd11P23813 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hoxd11P23813 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hoxd11P23813 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hoxd11P23813 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hoxd11P23813 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hoxd11P23813 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hoxd11P23813 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hoxd11P23813 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hoxd11P23813 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Hoxd11P23813 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hoxd11P23813 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hoxd11P23813 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Hoxd11P23813 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Hoxd11P23813 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Hoxd11P23813 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Hoxd11P23813 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hoxd11P23813 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hoxd11P23813 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hoxd11P23813 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Hoxd11P23813 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hoxd11P23813 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hoxd11P23813 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hoxd11P23813 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hoxd11P23813 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hoxd11P23813 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hoxd11P23813 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Hoxd11P23813 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hoxd11P23813 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hoxd11P23813 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hoxd11P23813 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hoxd11P23813 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hoxd11P23813 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hoxd11P23813 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hoxd11P23813 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hoxd11P23813 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hoxd11P23813 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hoxd11P23813 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hoxd11P23813 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Hoxd11P23813 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Hoxd11P23813 Pinx1-201ENSMUST00000022528 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hoxd11P23813 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hoxd11P23813 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hoxd11P23813 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Hoxd11P23813 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hoxd11P23813 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hoxd11P23813 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hoxd11P23813 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hoxd11P23813 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hoxd11P23813 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hoxd11P23813 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hoxd11P23813 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hoxd11P23813 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Hoxd11P23813 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hoxd11P23813 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Hoxd11P23813 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hoxd11P23813 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hoxd11P23813 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hoxd11P23813 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hoxd11P23813 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hoxd11P23813 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Hoxd11P23813 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Hoxd11P23813 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hoxd11P23813 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hoxd11P23813 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hoxd11P23813 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hoxd11P23813 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hoxd11P23813 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hoxd11P23813 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hoxd11P23813 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hoxd11P23813 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hoxd11P23813 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hoxd11P23813 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hoxd11P23813 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Hoxd11P23813 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Hoxd11P23813 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hoxd11P23813 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hoxd11P23813 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hoxd11P23813 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hoxd11P23813 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hoxd11P23813 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hoxd11P23813 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hoxd11P23813 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Hoxd11P23813 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Hoxd11P23813 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Hoxd11P23813 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hoxd11P23813 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
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