Protein–RNA interactions for Protein: P23475

Xrcc6, X-ray repair cross-complementing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc6P23475 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Xrcc6P23475 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Xrcc6P23475 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Xrcc6P23475 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Xrcc6P23475 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Xrcc6P23475 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Xrcc6P23475 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Xrcc6P23475 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Xrcc6P23475 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xrcc6P23475 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xrcc6P23475 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xrcc6P23475 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Xrcc6P23475 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Xrcc6P23475 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Xrcc6P23475 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Xrcc6P23475 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Xrcc6P23475 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xrcc6P23475 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xrcc6P23475 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Xrcc6P23475 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Xrcc6P23475 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Xrcc6P23475 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Xrcc6P23475 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Xrcc6P23475 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Xrcc6P23475 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Xrcc6P23475 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Xrcc6P23475 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Xrcc6P23475 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Xrcc6P23475 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xrcc6P23475 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xrcc6P23475 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xrcc6P23475 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xrcc6P23475 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xrcc6P23475 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Xrcc6P23475 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Xrcc6P23475 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Xrcc6P23475 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Xrcc6P23475 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Xrcc6P23475 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Xrcc6P23475 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Xrcc6P23475 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Xrcc6P23475 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Xrcc6P23475 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Xrcc6P23475 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Xrcc6P23475 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Xrcc6P23475 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Xrcc6P23475 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Xrcc6P23475 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Xrcc6P23475 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Xrcc6P23475 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Xrcc6P23475 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Xrcc6P23475 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Xrcc6P23475 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Xrcc6P23475 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xrcc6P23475 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xrcc6P23475 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xrcc6P23475 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xrcc6P23475 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xrcc6P23475 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xrcc6P23475 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xrcc6P23475 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xrcc6P23475 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xrcc6P23475 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xrcc6P23475 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xrcc6P23475 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xrcc6P23475 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xrcc6P23475 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xrcc6P23475 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xrcc6P23475 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xrcc6P23475 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Xrcc6P23475 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Xrcc6P23475 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Xrcc6P23475 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Xrcc6P23475 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Xrcc6P23475 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Xrcc6P23475 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Xrcc6P23475 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Xrcc6P23475 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Xrcc6P23475 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Xrcc6P23475 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Xrcc6P23475 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Xrcc6P23475 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Xrcc6P23475 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Xrcc6P23475 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Xrcc6P23475 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Xrcc6P23475 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Xrcc6P23475 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Xrcc6P23475 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Xrcc6P23475 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Xrcc6P23475 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Xrcc6P23475 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Xrcc6P23475 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Xrcc6P23475 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Xrcc6P23475 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Xrcc6P23475 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Xrcc6P23475 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Xrcc6P23475 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Xrcc6P23475 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Xrcc6P23475 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Xrcc6P23475 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms