Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata1P17679 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gata1P17679 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gata1P17679 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gata1P17679 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata1P17679 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata1P17679 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata1P17679 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata1P17679 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata1P17679 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata1P17679 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata1P17679 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata1P17679 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gata1P17679 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gata1P17679 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gata1P17679 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gata1P17679 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gata1P17679 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gata1P17679 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gata1P17679 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gata1P17679 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gata1P17679 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata1P17679 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata1P17679 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata1P17679 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata1P17679 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata1P17679 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata1P17679 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata1P17679 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata1P17679 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gata1P17679 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gata1P17679 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gata1P17679 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gata1P17679 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gata1P17679 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gata1P17679 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gata1P17679 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gata1P17679 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gata1P17679 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gata1P17679 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gata1P17679 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gata1P17679 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gata1P17679 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gata1P17679 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gata1P17679 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gata1P17679 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gata1P17679 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gata1P17679 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gata1P17679 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gata1P17679 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gata1P17679 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gata1P17679 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gata1P17679 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gata1P17679 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gata1P17679 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gata1P17679 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gata1P17679 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gata1P17679 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gata1P17679 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gata1P17679 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gata1P17679 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gata1P17679 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms