Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Dnmt1P13864 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Dnmt1P13864 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Dnmt1P13864 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Dnmt1P13864 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Dnmt1P13864 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Dnmt1P13864 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
Dnmt1P13864 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Dnmt1P13864 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Dnmt1P13864 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Dnmt1P13864 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Dnmt1P13864 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Dnmt1P13864 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
Dnmt1P13864 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Dnmt1P13864 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Dnmt1P13864 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Dnmt1P13864 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Dnmt1P13864 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Dnmt1P13864 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
Dnmt1P13864 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Dnmt1P13864 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Dnmt1P13864 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
Dnmt1P13864 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Dnmt1P13864 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Dnmt1P13864 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Dnmt1P13864 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Dnmt1P13864 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Dnmt1P13864 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Dnmt1P13864 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Dnmt1P13864 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Dnmt1P13864 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
Dnmt1P13864 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Dnmt1P13864 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Dnmt1P13864 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Dnmt1P13864 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Dnmt1P13864 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Dnmt1P13864 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Dnmt1P13864 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Dnmt1P13864 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Dnmt1P13864 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
Dnmt1P13864 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Dnmt1P13864 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Dnmt1P13864 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Dnmt1P13864 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Dnmt1P13864 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Dnmt1P13864 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Dnmt1P13864 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Dnmt1P13864 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Dnmt1P13864 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Dnmt1P13864 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Dnmt1P13864 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Dnmt1P13864 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Dnmt1P13864 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Dnmt1P13864 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Dnmt1P13864 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Dnmt1P13864 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Dnmt1P13864 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Dnmt1P13864 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Dnmt1P13864 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
Dnmt1P13864 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Dnmt1P13864 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Dnmt1P13864 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Dnmt1P13864 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Dnmt1P13864 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Dnmt1P13864 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Dnmt1P13864 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.21
Dnmt1P13864 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Dnmt1P13864 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Dnmt1P13864 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Dnmt1P13864 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Dnmt1P13864 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Dnmt1P13864 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Dnmt1P13864 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Dnmt1P13864 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Dnmt1P13864 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Dnmt1P13864 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Dnmt1P13864 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Dnmt1P13864 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Dnmt1P13864 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Dnmt1P13864 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
Dnmt1P13864 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
Dnmt1P13864 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Dnmt1P13864 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Dnmt1P13864 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Dnmt1P13864 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Dnmt1P13864 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Dnmt1P13864 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Dnmt1P13864 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Dnmt1P13864 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Dnmt1P13864 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
Dnmt1P13864 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Dnmt1P13864 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
Dnmt1P13864 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Dnmt1P13864 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Dnmt1P13864 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Dnmt1P13864 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Dnmt1P13864 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Dnmt1P13864 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Dnmt1P13864 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Dnmt1P13864 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms