Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NeflP08551 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NeflP08551 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NeflP08551 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NeflP08551 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NeflP08551 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NeflP08551 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NeflP08551 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NeflP08551 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NeflP08551 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NeflP08551 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NeflP08551 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NeflP08551 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NeflP08551 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NeflP08551 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NeflP08551 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NeflP08551 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NeflP08551 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NeflP08551 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NeflP08551 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NeflP08551 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NeflP08551 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NeflP08551 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NeflP08551 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NeflP08551 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NeflP08551 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NeflP08551 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NeflP08551 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NeflP08551 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NeflP08551 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NeflP08551 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NeflP08551 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NeflP08551 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NeflP08551 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NeflP08551 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NeflP08551 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NeflP08551 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NeflP08551 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NeflP08551 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NeflP08551 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NeflP08551 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NeflP08551 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NeflP08551 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NeflP08551 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NeflP08551 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NeflP08551 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NeflP08551 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NeflP08551 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NeflP08551 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NeflP08551 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NeflP08551 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NeflP08551 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NeflP08551 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NeflP08551 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NeflP08551 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NeflP08551 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NeflP08551 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NeflP08551 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NeflP08551 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NeflP08551 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NeflP08551 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NeflP08551 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NeflP08551 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NeflP08551 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NeflP08551 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NeflP08551 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NeflP08551 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NeflP08551 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NeflP08551 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NeflP08551 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NeflP08551 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NeflP08551 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NeflP08551 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NeflP08551 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NeflP08551 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NeflP08551 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NeflP08551 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NeflP08551 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NeflP08551 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NeflP08551 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NeflP08551 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NeflP08551 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NeflP08551 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NeflP08551 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NeflP08551 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NeflP08551 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NeflP08551 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NeflP08551 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NeflP08551 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NeflP08551 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NeflP08551 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NeflP08551 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NeflP08551 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NeflP08551 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NeflP08551 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NeflP08551 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NeflP08551 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NeflP08551 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NeflP08551 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NeflP08551 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms