Protein–RNA interactions for Protein: P07350

Ifna6, Interferon alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna6P07350 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifna6P07350 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifna6P07350 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifna6P07350 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifna6P07350 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifna6P07350 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifna6P07350 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifna6P07350 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifna6P07350 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifna6P07350 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifna6P07350 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifna6P07350 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifna6P07350 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifna6P07350 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifna6P07350 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifna6P07350 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifna6P07350 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifna6P07350 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifna6P07350 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifna6P07350 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifna6P07350 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ifna6P07350 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifna6P07350 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifna6P07350 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifna6P07350 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifna6P07350 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifna6P07350 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifna6P07350 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifna6P07350 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifna6P07350 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifna6P07350 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifna6P07350 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifna6P07350 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifna6P07350 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifna6P07350 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifna6P07350 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifna6P07350 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifna6P07350 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifna6P07350 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifna6P07350 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifna6P07350 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifna6P07350 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifna6P07350 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifna6P07350 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifna6P07350 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifna6P07350 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifna6P07350 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifna6P07350 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifna6P07350 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifna6P07350 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifna6P07350 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifna6P07350 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifna6P07350 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifna6P07350 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifna6P07350 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifna6P07350 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifna6P07350 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifna6P07350 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifna6P07350 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifna6P07350 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifna6P07350 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifna6P07350 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifna6P07350 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifna6P07350 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifna6P07350 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ifna6P07350 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ifna6P07350 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifna6P07350 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifna6P07350 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifna6P07350 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifna6P07350 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifna6P07350 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifna6P07350 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ifna6P07350 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ifna6P07350 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ifna6P07350 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ifna6P07350 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ifna6P07350 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifna6P07350 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ifna6P07350 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifna6P07350 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifna6P07350 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifna6P07350 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifna6P07350 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifna6P07350 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifna6P07350 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifna6P07350 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifna6P07350 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifna6P07350 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifna6P07350 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifna6P07350 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifna6P07350 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifna6P07350 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifna6P07350 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifna6P07350 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifna6P07350 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna6P07350 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna6P07350 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna6P07350 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifna6P07350 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms