Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Me1P06801 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Me1P06801 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Me1P06801 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Me1P06801 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Me1P06801 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Me1P06801 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Me1P06801 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Me1P06801 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Me1P06801 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Me1P06801 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Me1P06801 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Me1P06801 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Me1P06801 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Me1P06801 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Me1P06801 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Me1P06801 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Me1P06801 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Me1P06801 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Me1P06801 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Me1P06801 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Me1P06801 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Me1P06801 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Me1P06801 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Me1P06801 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Me1P06801 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Me1P06801 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Me1P06801 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Me1P06801 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Me1P06801 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Me1P06801 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Me1P06801 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Me1P06801 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Me1P06801 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Me1P06801 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Me1P06801 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Me1P06801 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Me1P06801 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
Me1P06801 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Me1P06801 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Me1P06801 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Me1P06801 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Me1P06801 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Me1P06801 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Me1P06801 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Me1P06801 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Me1P06801 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Me1P06801 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Me1P06801 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Me1P06801 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Me1P06801 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Me1P06801 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Me1P06801 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Me1P06801 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Me1P06801 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Me1P06801 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Me1P06801 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Me1P06801 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Me1P06801 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Me1P06801 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Me1P06801 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Me1P06801 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Me1P06801 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Me1P06801 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Me1P06801 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Me1P06801 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Me1P06801 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Me1P06801 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Me1P06801 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Me1P06801 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Me1P06801 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Me1P06801 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Me1P06801 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Me1P06801 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Me1P06801 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Me1P06801 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Me1P06801 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Me1P06801 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Me1P06801 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Me1P06801 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Me1P06801 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Me1P06801 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Me1P06801 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Me1P06801 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Me1P06801 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Me1P06801 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Me1P06801 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Me1P06801 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Me1P06801 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Me1P06801 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Me1P06801 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Me1P06801 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Me1P06801 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Me1P06801 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Me1P06801 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Me1P06801 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Me1P06801 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Me1P06801 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Me1P06801 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Me1P06801 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms