Protein–RNA interactions for Protein: P05201

Got1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Got1P05201 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Got1P05201 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Got1P05201 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Got1P05201 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Got1P05201 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Got1P05201 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Got1P05201 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Got1P05201 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Got1P05201 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Got1P05201 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Got1P05201 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Got1P05201 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Got1P05201 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Got1P05201 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Got1P05201 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Got1P05201 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Got1P05201 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Got1P05201 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Got1P05201 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Got1P05201 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Got1P05201 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Got1P05201 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Got1P05201 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Got1P05201 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Got1P05201 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Got1P05201 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Got1P05201 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Got1P05201 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Got1P05201 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Got1P05201 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Got1P05201 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Got1P05201 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Got1P05201 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Got1P05201 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Got1P05201 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Got1P05201 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Got1P05201 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Got1P05201 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Got1P05201 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Got1P05201 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Got1P05201 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Got1P05201 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Got1P05201 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Got1P05201 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Got1P05201 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Got1P05201 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Got1P05201 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Got1P05201 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Got1P05201 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Got1P05201 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Got1P05201 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Got1P05201 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Got1P05201 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Got1P05201 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Got1P05201 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Got1P05201 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Got1P05201 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Got1P05201 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Got1P05201 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Got1P05201 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Got1P05201 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Got1P05201 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Got1P05201 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Got1P05201 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Got1P05201 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Got1P05201 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Got1P05201 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Got1P05201 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Got1P05201 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Got1P05201 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Got1P05201 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Got1P05201 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Got1P05201 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Got1P05201 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Got1P05201 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Got1P05201 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Got1P05201 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Got1P05201 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Got1P05201 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Got1P05201 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Got1P05201 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Got1P05201 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Got1P05201 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Got1P05201 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Got1P05201 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Got1P05201 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Got1P05201 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Got1P05201 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Got1P05201 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Got1P05201 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Got1P05201 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Got1P05201 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Got1P05201 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Got1P05201 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Got1P05201 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Got1P05201 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Got1P05201 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Got1P05201 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Got1P05201 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Got1P05201 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms