Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CrygdP04342 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CrygdP04342 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CrygdP04342 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CrygdP04342 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CrygdP04342 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CrygdP04342 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CrygdP04342 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CrygdP04342 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrygdP04342 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrygdP04342 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrygdP04342 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrygdP04342 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrygdP04342 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CrygdP04342 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrygdP04342 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrygdP04342 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrygdP04342 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrygdP04342 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrygdP04342 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrygdP04342 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CrygdP04342 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CrygdP04342 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CrygdP04342 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CrygdP04342 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CrygdP04342 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CrygdP04342 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CrygdP04342 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrygdP04342 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrygdP04342 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrygdP04342 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrygdP04342 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrygdP04342 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrygdP04342 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrygdP04342 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrygdP04342 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrygdP04342 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrygdP04342 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CrygdP04342 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CrygdP04342 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CrygdP04342 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CrygdP04342 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CrygdP04342 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrygdP04342 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrygdP04342 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrygdP04342 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrygdP04342 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrygdP04342 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrygdP04342 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrygdP04342 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrygdP04342 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrygdP04342 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms