Protein–RNA interactions for Protein: P02463

Col4a1, Collagen alpha-1(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a1P02463 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Col4a1P02463 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Col4a1P02463 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Col4a1P02463 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Col4a1P02463 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Col4a1P02463 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Col4a1P02463 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Col4a1P02463 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Col4a1P02463 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Col4a1P02463 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Col4a1P02463 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Col4a1P02463 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Col4a1P02463 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Col4a1P02463 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Col4a1P02463 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Col4a1P02463 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Col4a1P02463 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Col4a1P02463 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Col4a1P02463 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Col4a1P02463 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Col4a1P02463 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Col4a1P02463 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Col4a1P02463 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Col4a1P02463 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Col4a1P02463 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Col4a1P02463 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Col4a1P02463 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Col4a1P02463 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Col4a1P02463 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Col4a1P02463 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Col4a1P02463 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Col4a1P02463 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Col4a1P02463 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Col4a1P02463 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Col4a1P02463 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Col4a1P02463 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Col4a1P02463 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Col4a1P02463 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Col4a1P02463 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Col4a1P02463 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Col4a1P02463 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Col4a1P02463 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Col4a1P02463 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Col4a1P02463 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Col4a1P02463 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Col4a1P02463 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Col4a1P02463 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Col4a1P02463 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Col4a1P02463 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Col4a1P02463 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Col4a1P02463 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Col4a1P02463 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Col4a1P02463 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Col4a1P02463 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Col4a1P02463 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Col4a1P02463 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Col4a1P02463 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Col4a1P02463 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col4a1P02463 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col4a1P02463 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col4a1P02463 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Col4a1P02463 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Col4a1P02463 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Col4a1P02463 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Col4a1P02463 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Col4a1P02463 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Col4a1P02463 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Col4a1P02463 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Col4a1P02463 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Col4a1P02463 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Col4a1P02463 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Col4a1P02463 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Col4a1P02463 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Col4a1P02463 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Col4a1P02463 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Col4a1P02463 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Col4a1P02463 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Col4a1P02463 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Col4a1P02463 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Col4a1P02463 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Col4a1P02463 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Col4a1P02463 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Col4a1P02463 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Col4a1P02463 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Col4a1P02463 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Col4a1P02463 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Col4a1P02463 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Col4a1P02463 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Col4a1P02463 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Col4a1P02463 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Col4a1P02463 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Col4a1P02463 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Col4a1P02463 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Col4a1P02463 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Col4a1P02463 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Col4a1P02463 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Col4a1P02463 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Col4a1P02463 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Col4a1P02463 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Col4a1P02463 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms