Protein–RNA interactions for Protein: O89051

Itm2b, Integral membrane protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2bO89051 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itm2bO89051 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itm2bO89051 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itm2bO89051 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itm2bO89051 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itm2bO89051 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itm2bO89051 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itm2bO89051 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itm2bO89051 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itm2bO89051 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Itm2bO89051 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itm2bO89051 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itm2bO89051 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itm2bO89051 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itm2bO89051 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Itm2bO89051 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itm2bO89051 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itm2bO89051 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itm2bO89051 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itm2bO89051 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itm2bO89051 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itm2bO89051 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itm2bO89051 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itm2bO89051 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Itm2bO89051 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Itm2bO89051 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itm2bO89051 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itm2bO89051 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itm2bO89051 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itm2bO89051 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itm2bO89051 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itm2bO89051 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itm2bO89051 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Itm2bO89051 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itm2bO89051 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itm2bO89051 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itm2bO89051 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itm2bO89051 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itm2bO89051 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itm2bO89051 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itm2bO89051 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Itm2bO89051 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itm2bO89051 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itm2bO89051 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itm2bO89051 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itm2bO89051 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itm2bO89051 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itm2bO89051 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itm2bO89051 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itm2bO89051 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itm2bO89051 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itm2bO89051 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itm2bO89051 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itm2bO89051 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itm2bO89051 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itm2bO89051 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itm2bO89051 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itm2bO89051 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itm2bO89051 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itm2bO89051 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itm2bO89051 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itm2bO89051 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itm2bO89051 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itm2bO89051 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itm2bO89051 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itm2bO89051 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itm2bO89051 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itm2bO89051 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itm2bO89051 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itm2bO89051 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itm2bO89051 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itm2bO89051 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itm2bO89051 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itm2bO89051 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itm2bO89051 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itm2bO89051 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itm2bO89051 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Itm2bO89051 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itm2bO89051 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itm2bO89051 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itm2bO89051 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itm2bO89051 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itm2bO89051 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itm2bO89051 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itm2bO89051 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itm2bO89051 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itm2bO89051 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itm2bO89051 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itm2bO89051 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Itm2bO89051 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itm2bO89051 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itm2bO89051 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itm2bO89051 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itm2bO89051 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itm2bO89051 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itm2bO89051 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itm2bO89051 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itm2bO89051 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itm2bO89051 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itm2bO89051 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms