Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Cfdp1O88271 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cfdp1O88271 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cfdp1O88271 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cfdp1O88271 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cfdp1O88271 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cfdp1O88271 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cfdp1O88271 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cfdp1O88271 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cfdp1O88271 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cfdp1O88271 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cfdp1O88271 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cfdp1O88271 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cfdp1O88271 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cfdp1O88271 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cfdp1O88271 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cfdp1O88271 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cfdp1O88271 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cfdp1O88271 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cfdp1O88271 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cfdp1O88271 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cfdp1O88271 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cfdp1O88271 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cfdp1O88271 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cfdp1O88271 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cfdp1O88271 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cfdp1O88271 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cfdp1O88271 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cfdp1O88271 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cfdp1O88271 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cfdp1O88271 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cfdp1O88271 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cfdp1O88271 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cfdp1O88271 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cfdp1O88271 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cfdp1O88271 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Cfdp1O88271 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cfdp1O88271 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cfdp1O88271 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cfdp1O88271 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cfdp1O88271 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Cfdp1O88271 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cfdp1O88271 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cfdp1O88271 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cfdp1O88271 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cfdp1O88271 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cfdp1O88271 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cfdp1O88271 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cfdp1O88271 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cfdp1O88271 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cfdp1O88271 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Cfdp1O88271 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cfdp1O88271 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cfdp1O88271 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Cfdp1O88271 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cfdp1O88271 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cfdp1O88271 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cfdp1O88271 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cfdp1O88271 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cfdp1O88271 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cfdp1O88271 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cfdp1O88271 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Cfdp1O88271 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Cfdp1O88271 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Cfdp1O88271 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cfdp1O88271 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cfdp1O88271 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Cfdp1O88271 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cfdp1O88271 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cfdp1O88271 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Cfdp1O88271 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Cfdp1O88271 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Cfdp1O88271 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cfdp1O88271 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cfdp1O88271 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cfdp1O88271 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cfdp1O88271 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cfdp1O88271 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cfdp1O88271 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cfdp1O88271 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cfdp1O88271 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cfdp1O88271 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cfdp1O88271 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cfdp1O88271 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cfdp1O88271 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cfdp1O88271 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cfdp1O88271 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cfdp1O88271 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cfdp1O88271 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cfdp1O88271 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cfdp1O88271 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cfdp1O88271 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cfdp1O88271 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cfdp1O88271 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cfdp1O88271 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cfdp1O88271 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cfdp1O88271 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cfdp1O88271 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cfdp1O88271 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cfdp1O88271 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.2 ms