Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Vamp4O70480 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Vamp4O70480 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Vamp4O70480 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Vamp4O70480 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Vamp4O70480 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Vamp4O70480 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Vamp4O70480 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Vamp4O70480 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Vamp4O70480 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Vamp4O70480 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Vamp4O70480 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Vamp4O70480 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Vamp4O70480 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Vamp4O70480 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Vamp4O70480 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Vamp4O70480 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Vamp4O70480 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Vamp4O70480 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Vamp4O70480 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Vamp4O70480 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Vamp4O70480 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Vamp4O70480 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Vamp4O70480 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Vamp4O70480 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Vamp4O70480 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Vamp4O70480 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Vamp4O70480 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Vamp4O70480 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Vamp4O70480 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Vamp4O70480 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Vamp4O70480 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Vamp4O70480 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Vamp4O70480 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Vamp4O70480 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Vamp4O70480 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Vamp4O70480 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Vamp4O70480 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Vamp4O70480 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Vamp4O70480 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Vamp4O70480 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Vamp4O70480 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Vamp4O70480 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Vamp4O70480 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Vamp4O70480 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Vamp4O70480 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Vamp4O70480 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Vamp4O70480 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Vamp4O70480 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Vamp4O70480 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Vamp4O70480 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Vamp4O70480 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Vamp4O70480 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Vamp4O70480 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Vamp4O70480 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Vamp4O70480 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Vamp4O70480 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Vamp4O70480 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Vamp4O70480 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Vamp4O70480 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Vamp4O70480 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Vamp4O70480 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Vamp4O70480 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Vamp4O70480 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Vamp4O70480 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Vamp4O70480 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Vamp4O70480 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Vamp4O70480 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Vamp4O70480 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Vamp4O70480 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Vamp4O70480 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Vamp4O70480 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Vamp4O70480 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Vamp4O70480 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Vamp4O70480 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Vamp4O70480 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Vamp4O70480 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Vamp4O70480 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Vamp4O70480 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Vamp4O70480 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Vamp4O70480 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Vamp4O70480 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Vamp4O70480 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Vamp4O70480 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Vamp4O70480 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Vamp4O70480 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Vamp4O70480 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Vamp4O70480 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Vamp4O70480 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Vamp4O70480 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Vamp4O70480 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Vamp4O70480 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Vamp4O70480 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Vamp4O70480 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Vamp4O70480 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Vamp4O70480 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Vamp4O70480 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Vamp4O70480 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vamp4O70480 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vamp4O70480 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms