Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nipsnap1O55125 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nipsnap1O55125 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nipsnap1O55125 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nipsnap1O55125 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nipsnap1O55125 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nipsnap1O55125 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nipsnap1O55125 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nipsnap1O55125 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nipsnap1O55125 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nipsnap1O55125 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nipsnap1O55125 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nipsnap1O55125 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nipsnap1O55125 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nipsnap1O55125 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nipsnap1O55125 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nipsnap1O55125 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nipsnap1O55125 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nipsnap1O55125 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nipsnap1O55125 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nipsnap1O55125 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nipsnap1O55125 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nipsnap1O55125 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nipsnap1O55125 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nipsnap1O55125 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nipsnap1O55125 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nipsnap1O55125 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nipsnap1O55125 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nipsnap1O55125 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nipsnap1O55125 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nipsnap1O55125 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nipsnap1O55125 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nipsnap1O55125 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap1O55125 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap1O55125 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap1O55125 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap1O55125 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap1O55125 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap1O55125 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nipsnap1O55125 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nipsnap1O55125 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nipsnap1O55125 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Nipsnap1O55125 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nipsnap1O55125 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nipsnap1O55125 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nipsnap1O55125 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nipsnap1O55125 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nipsnap1O55125 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nipsnap1O55125 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nipsnap1O55125 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nipsnap1O55125 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nipsnap1O55125 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap1O55125 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap1O55125 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap1O55125 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap1O55125 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap1O55125 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap1O55125 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nipsnap1O55125 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nipsnap1O55125 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nipsnap1O55125 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nipsnap1O55125 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nipsnap1O55125 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nipsnap1O55125 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nipsnap1O55125 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nipsnap1O55125 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nipsnap1O55125 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nipsnap1O55125 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nipsnap1O55125 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nipsnap1O55125 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nipsnap1O55125 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nipsnap1O55125 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nipsnap1O55125 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nipsnap1O55125 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Nipsnap1O55125 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nipsnap1O55125 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nipsnap1O55125 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nipsnap1O55125 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nipsnap1O55125 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nipsnap1O55125 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nipsnap1O55125 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nipsnap1O55125 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nipsnap1O55125 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nipsnap1O55125 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nipsnap1O55125 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nipsnap1O55125 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nipsnap1O55125 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nipsnap1O55125 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nipsnap1O55125 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nipsnap1O55125 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Nipsnap1O55125 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nipsnap1O55125 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nipsnap1O55125 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nipsnap1O55125 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nipsnap1O55125 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nipsnap1O55125 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nipsnap1O55125 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nipsnap1O55125 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap1O55125 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap1O55125 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms