Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Copb2O55029 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Copb2O55029 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Copb2O55029 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Copb2O55029 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Copb2O55029 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Copb2O55029 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Copb2O55029 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Copb2O55029 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Copb2O55029 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Copb2O55029 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Copb2O55029 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Copb2O55029 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Copb2O55029 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Copb2O55029 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Copb2O55029 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Copb2O55029 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Copb2O55029 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Copb2O55029 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Copb2O55029 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Copb2O55029 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Copb2O55029 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Copb2O55029 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Copb2O55029 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Copb2O55029 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Copb2O55029 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Copb2O55029 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Copb2O55029 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Copb2O55029 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Copb2O55029 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Copb2O55029 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Copb2O55029 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Copb2O55029 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Copb2O55029 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Copb2O55029 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Copb2O55029 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Copb2O55029 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Copb2O55029 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Copb2O55029 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Copb2O55029 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Copb2O55029 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Copb2O55029 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Copb2O55029 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Copb2O55029 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Copb2O55029 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Copb2O55029 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Copb2O55029 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Copb2O55029 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Copb2O55029 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Copb2O55029 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Copb2O55029 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Copb2O55029 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Copb2O55029 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Copb2O55029 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Copb2O55029 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Copb2O55029 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Copb2O55029 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Copb2O55029 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Copb2O55029 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Copb2O55029 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Copb2O55029 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Copb2O55029 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Copb2O55029 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Copb2O55029 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Copb2O55029 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Copb2O55029 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Copb2O55029 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Copb2O55029 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Copb2O55029 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Copb2O55029 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Copb2O55029 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Copb2O55029 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Copb2O55029 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Copb2O55029 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Copb2O55029 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Copb2O55029 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Copb2O55029 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Copb2O55029 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Copb2O55029 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Copb2O55029 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Copb2O55029 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Copb2O55029 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Copb2O55029 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Copb2O55029 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Copb2O55029 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Copb2O55029 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Copb2O55029 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Copb2O55029 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Copb2O55029 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Copb2O55029 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Copb2O55029 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Copb2O55029 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Copb2O55029 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Copb2O55029 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Copb2O55029 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Copb2O55029 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Copb2O55029 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Copb2O55029 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Copb2O55029 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Copb2O55029 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms