Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cldn5O54942 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cldn5O54942 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cldn5O54942 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cldn5O54942 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cldn5O54942 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cldn5O54942 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cldn5O54942 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cldn5O54942 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cldn5O54942 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cldn5O54942 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cldn5O54942 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cldn5O54942 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cldn5O54942 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cldn5O54942 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cldn5O54942 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cldn5O54942 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cldn5O54942 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cldn5O54942 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cldn5O54942 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cldn5O54942 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cldn5O54942 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cldn5O54942 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cldn5O54942 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cldn5O54942 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cldn5O54942 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cldn5O54942 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cldn5O54942 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cldn5O54942 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cldn5O54942 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cldn5O54942 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cldn5O54942 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cldn5O54942 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cldn5O54942 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cldn5O54942 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cldn5O54942 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cldn5O54942 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cldn5O54942 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cldn5O54942 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cldn5O54942 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cldn5O54942 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cldn5O54942 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cldn5O54942 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cldn5O54942 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cldn5O54942 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cldn5O54942 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cldn5O54942 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cldn5O54942 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cldn5O54942 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cldn5O54942 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cldn5O54942 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cldn5O54942 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cldn5O54942 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cldn5O54942 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cldn5O54942 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cldn5O54942 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cldn5O54942 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cldn5O54942 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cldn5O54942 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cldn5O54942 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cldn5O54942 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cldn5O54942 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cldn5O54942 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cldn5O54942 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cldn5O54942 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cldn5O54942 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cldn5O54942 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cldn5O54942 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cldn5O54942 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cldn5O54942 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cldn5O54942 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cldn5O54942 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cldn5O54942 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cldn5O54942 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cldn5O54942 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cldn5O54942 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cldn5O54942 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cldn5O54942 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cldn5O54942 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cldn5O54942 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cldn5O54942 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cldn5O54942 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cldn5O54942 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cldn5O54942 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cldn5O54942 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cldn5O54942 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cldn5O54942 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cldn5O54942 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cldn5O54942 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cldn5O54942 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cldn5O54942 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cldn5O54942 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cldn5O54942 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cldn5O54942 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cldn5O54942 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cldn5O54942 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cldn5O54942 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cldn5O54942 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cldn5O54942 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cldn5O54942 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms