Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdh16O54909 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdh16O54909 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdh16O54909 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdh16O54909 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdh16O54909 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdh16O54909 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdh16O54909 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdh16O54909 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdh16O54909 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh16O54909 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh16O54909 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh16O54909 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh16O54909 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh16O54909 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh16O54909 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh16O54909 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh16O54909 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdh16O54909 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdh16O54909 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdh16O54909 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdh16O54909 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh16O54909 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh16O54909 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Rdh16O54909 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
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Rdh16O54909 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
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Rdh16O54909 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh16O54909 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh16O54909 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh16O54909 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh16O54909 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh16O54909 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh16O54909 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh16O54909 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh16O54909 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Rdh16O54909 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Rdh16O54909 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh16O54909 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh16O54909 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh16O54909 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdh16O54909 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdh16O54909 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdh16O54909 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdh16O54909 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdh16O54909 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdh16O54909 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdh16O54909 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdh16O54909 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdh16O54909 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdh16O54909 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdh16O54909 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Rdh16O54909 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh16O54909 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh16O54909 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh16O54909 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh16O54909 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh16O54909 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh16O54909 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh16O54909 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh16O54909 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh16O54909 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh16O54909 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh16O54909 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh16O54909 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh16O54909 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh16O54909 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh16O54909 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh16O54909 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh16O54909 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh16O54909 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh16O54909 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh16O54909 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh16O54909 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh16O54909 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh16O54909 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh16O54909 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh16O54909 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh16O54909 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh16O54909 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdh16O54909 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms