Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TsksO54887 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TsksO54887 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TsksO54887 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TsksO54887 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TsksO54887 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TsksO54887 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TsksO54887 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TsksO54887 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TsksO54887 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TsksO54887 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TsksO54887 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TsksO54887 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TsksO54887 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TsksO54887 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TsksO54887 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TsksO54887 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TsksO54887 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TsksO54887 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TsksO54887 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TsksO54887 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TsksO54887 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TsksO54887 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TsksO54887 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TsksO54887 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TsksO54887 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TsksO54887 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TsksO54887 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TsksO54887 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TsksO54887 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TsksO54887 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TsksO54887 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TsksO54887 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TsksO54887 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TsksO54887 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TsksO54887 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TsksO54887 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TsksO54887 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TsksO54887 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TsksO54887 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TsksO54887 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TsksO54887 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TsksO54887 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TsksO54887 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TsksO54887 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TsksO54887 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TsksO54887 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TsksO54887 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TsksO54887 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TsksO54887 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TsksO54887 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TsksO54887 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TsksO54887 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TsksO54887 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TsksO54887 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TsksO54887 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TsksO54887 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TsksO54887 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TsksO54887 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TsksO54887 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TsksO54887 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TsksO54887 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TsksO54887 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TsksO54887 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TsksO54887 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TsksO54887 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TsksO54887 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TsksO54887 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TsksO54887 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TsksO54887 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TsksO54887 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TsksO54887 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TsksO54887 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TsksO54887 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TsksO54887 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TsksO54887 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TsksO54887 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TsksO54887 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TsksO54887 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TsksO54887 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TsksO54887 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TsksO54887 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TsksO54887 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TsksO54887 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TsksO54887 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TsksO54887 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TsksO54887 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TsksO54887 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TsksO54887 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TsksO54887 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TsksO54887 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TsksO54887 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TsksO54887 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TsksO54887 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TsksO54887 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TsksO54887 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TsksO54887 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TsksO54887 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TsksO54887 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TsksO54887 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms