Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Edil3O35474 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Edil3O35474 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Edil3O35474 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Edil3O35474 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Edil3O35474 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Edil3O35474 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Edil3O35474 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Edil3O35474 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Edil3O35474 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Edil3O35474 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Edil3O35474 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Edil3O35474 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Edil3O35474 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Edil3O35474 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Edil3O35474 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Edil3O35474 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Edil3O35474 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Edil3O35474 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Edil3O35474 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Edil3O35474 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Edil3O35474 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Edil3O35474 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Edil3O35474 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Edil3O35474 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Edil3O35474 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Edil3O35474 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Edil3O35474 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Edil3O35474 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Edil3O35474 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Edil3O35474 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Edil3O35474 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Edil3O35474 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Edil3O35474 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Edil3O35474 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Edil3O35474 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Edil3O35474 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Edil3O35474 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Edil3O35474 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Edil3O35474 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Edil3O35474 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Edil3O35474 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Edil3O35474 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Edil3O35474 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Edil3O35474 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Edil3O35474 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Edil3O35474 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Edil3O35474 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Edil3O35474 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Edil3O35474 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Edil3O35474 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Edil3O35474 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Edil3O35474 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Edil3O35474 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Edil3O35474 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Edil3O35474 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Edil3O35474 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Edil3O35474 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Edil3O35474 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Edil3O35474 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Edil3O35474 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Edil3O35474 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Edil3O35474 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Edil3O35474 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Edil3O35474 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Edil3O35474 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Edil3O35474 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Edil3O35474 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Edil3O35474 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Edil3O35474 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Edil3O35474 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Edil3O35474 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Edil3O35474 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Edil3O35474 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Edil3O35474 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Edil3O35474 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Edil3O35474 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Edil3O35474 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Edil3O35474 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Edil3O35474 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Edil3O35474 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Edil3O35474 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Edil3O35474 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Edil3O35474 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Edil3O35474 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Edil3O35474 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Edil3O35474 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Edil3O35474 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Edil3O35474 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Edil3O35474 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Edil3O35474 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Edil3O35474 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Edil3O35474 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Edil3O35474 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Edil3O35474 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Edil3O35474 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Edil3O35474 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Edil3O35474 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Edil3O35474 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Edil3O35474 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms