Protein–RNA interactions for Protein: O35454

Clcn6, Chloride transport protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn6O35454 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clcn6O35454 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clcn6O35454 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clcn6O35454 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clcn6O35454 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Clcn6O35454 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clcn6O35454 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clcn6O35454 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Clcn6O35454 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Clcn6O35454 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clcn6O35454 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Clcn6O35454 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Clcn6O35454 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clcn6O35454 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clcn6O35454 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clcn6O35454 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clcn6O35454 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clcn6O35454 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clcn6O35454 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clcn6O35454 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clcn6O35454 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clcn6O35454 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clcn6O35454 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clcn6O35454 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clcn6O35454 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clcn6O35454 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clcn6O35454 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clcn6O35454 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clcn6O35454 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clcn6O35454 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clcn6O35454 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clcn6O35454 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clcn6O35454 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clcn6O35454 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clcn6O35454 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clcn6O35454 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clcn6O35454 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clcn6O35454 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clcn6O35454 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clcn6O35454 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clcn6O35454 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clcn6O35454 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clcn6O35454 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clcn6O35454 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clcn6O35454 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clcn6O35454 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clcn6O35454 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clcn6O35454 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clcn6O35454 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clcn6O35454 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clcn6O35454 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clcn6O35454 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clcn6O35454 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clcn6O35454 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clcn6O35454 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clcn6O35454 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clcn6O35454 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clcn6O35454 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clcn6O35454 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clcn6O35454 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clcn6O35454 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clcn6O35454 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clcn6O35454 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clcn6O35454 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clcn6O35454 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clcn6O35454 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clcn6O35454 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clcn6O35454 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clcn6O35454 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clcn6O35454 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clcn6O35454 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clcn6O35454 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clcn6O35454 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clcn6O35454 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clcn6O35454 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clcn6O35454 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Clcn6O35454 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clcn6O35454 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clcn6O35454 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clcn6O35454 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clcn6O35454 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clcn6O35454 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clcn6O35454 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Clcn6O35454 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clcn6O35454 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clcn6O35454 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clcn6O35454 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clcn6O35454 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clcn6O35454 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clcn6O35454 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clcn6O35454 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clcn6O35454 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clcn6O35454 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clcn6O35454 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Clcn6O35454 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clcn6O35454 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clcn6O35454 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clcn6O35454 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clcn6O35454 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clcn6O35454 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms