Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxd2O35392 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxd2O35392 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxd2O35392 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxd2O35392 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxd2O35392 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxd2O35392 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxd2O35392 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxd2O35392 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxd2O35392 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxd2O35392 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxd2O35392 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxd2O35392 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxd2O35392 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxd2O35392 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxd2O35392 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxd2O35392 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxd2O35392 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxd2O35392 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxd2O35392 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxd2O35392 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxd2O35392 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxd2O35392 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxd2O35392 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxd2O35392 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxd2O35392 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Foxd2O35392 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Foxd2O35392 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxd2O35392 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxd2O35392 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxd2O35392 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxd2O35392 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxd2O35392 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxd2O35392 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxd2O35392 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxd2O35392 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxd2O35392 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxd2O35392 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxd2O35392 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxd2O35392 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxd2O35392 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxd2O35392 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxd2O35392 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxd2O35392 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxd2O35392 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxd2O35392 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxd2O35392 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxd2O35392 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxd2O35392 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxd2O35392 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxd2O35392 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxd2O35392 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxd2O35392 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxd2O35392 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxd2O35392 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxd2O35392 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxd2O35392 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxd2O35392 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxd2O35392 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxd2O35392 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxd2O35392 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxd2O35392 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxd2O35392 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxd2O35392 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxd2O35392 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxd2O35392 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxd2O35392 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxd2O35392 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxd2O35392 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Foxd2O35392 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Foxd2O35392 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxd2O35392 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxd2O35392 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxd2O35392 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Foxd2O35392 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxd2O35392 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Foxd2O35392 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxd2O35392 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Foxd2O35392 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxd2O35392 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxd2O35392 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxd2O35392 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Foxd2O35392 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Foxd2O35392 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Foxd2O35392 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Foxd2O35392 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Foxd2O35392 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Foxd2O35392 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxd2O35392 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxd2O35392 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Foxd2O35392 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Foxd2O35392 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxd2O35392 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxd2O35392 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxd2O35392 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Foxd2O35392 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Foxd2O35392 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxd2O35392 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxd2O35392 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Foxd2O35392 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms