Protein–RNA interactions for Protein: O08742

Gp5, Platelet glycoprotein V, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp5O08742 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gp5O08742 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gp5O08742 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gp5O08742 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gp5O08742 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gp5O08742 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gp5O08742 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gp5O08742 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gp5O08742 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gp5O08742 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gp5O08742 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gp5O08742 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gp5O08742 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gp5O08742 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gp5O08742 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gp5O08742 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gp5O08742 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gp5O08742 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gp5O08742 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gp5O08742 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gp5O08742 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gp5O08742 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gp5O08742 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gp5O08742 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gp5O08742 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gp5O08742 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gp5O08742 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gp5O08742 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gp5O08742 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gp5O08742 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gp5O08742 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gp5O08742 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gp5O08742 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gp5O08742 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gp5O08742 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gp5O08742 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gp5O08742 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gp5O08742 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gp5O08742 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gp5O08742 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gp5O08742 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gp5O08742 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gp5O08742 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gp5O08742 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gp5O08742 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gp5O08742 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gp5O08742 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gp5O08742 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gp5O08742 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gp5O08742 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gp5O08742 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gp5O08742 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gp5O08742 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gp5O08742 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gp5O08742 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gp5O08742 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gp5O08742 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gp5O08742 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gp5O08742 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gp5O08742 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gp5O08742 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gp5O08742 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gp5O08742 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gp5O08742 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gp5O08742 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gp5O08742 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gp5O08742 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gp5O08742 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gp5O08742 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gp5O08742 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gp5O08742 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Gp5O08742 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gp5O08742 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gp5O08742 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gp5O08742 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gp5O08742 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gp5O08742 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gp5O08742 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gp5O08742 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gp5O08742 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gp5O08742 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gp5O08742 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Gp5O08742 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gp5O08742 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gp5O08742 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gp5O08742 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gp5O08742 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gp5O08742 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gp5O08742 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gp5O08742 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gp5O08742 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gp5O08742 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gp5O08742 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gp5O08742 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gp5O08742 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gp5O08742 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gp5O08742 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gp5O08742 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gp5O08742 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gp5O08742 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms