Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Ccdc180J3QNE4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Ccdc180J3QNE4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
Ccdc180J3QNE4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Ccdc180J3QNE4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Ccdc180J3QNE4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Ccdc180J3QNE4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
Ccdc180J3QNE4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC41.36■■■■■ 4.21
Ccdc180J3QNE4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
Ccdc180J3QNE4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
Ccdc180J3QNE4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Ccdc180J3QNE4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Ccdc180J3QNE4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
Ccdc180J3QNE4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
Ccdc180J3QNE4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Ccdc180J3QNE4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Ccdc180J3QNE4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Ccdc180J3QNE4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.2
Ccdc180J3QNE4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
Ccdc180J3QNE4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
Ccdc180J3QNE4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC41.31■■■■■ 4.2
Ccdc180J3QNE4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Ccdc180J3QNE4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
Ccdc180J3QNE4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
Ccdc180J3QNE4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Ccdc180J3QNE4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Ccdc180J3QNE4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Ccdc180J3QNE4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Ccdc180J3QNE4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Ccdc180J3QNE4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Ccdc180J3QNE4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Ccdc180J3QNE4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC41.25■■■■■ 4.19
Ccdc180J3QNE4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
Ccdc180J3QNE4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Ccdc180J3QNE4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Ccdc180J3QNE4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Ccdc180J3QNE4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Ccdc180J3QNE4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Ccdc180J3QNE4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Ccdc180J3QNE4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Ccdc180J3QNE4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Ccdc180J3QNE4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Ccdc180J3QNE4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
Ccdc180J3QNE4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Ccdc180J3QNE4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Ccdc180J3QNE4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Ccdc180J3QNE4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Ccdc180J3QNE4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC41.19■■■■■ 4.18
Ccdc180J3QNE4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Ccdc180J3QNE4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Ccdc180J3QNE4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
Ccdc180J3QNE4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
Ccdc180J3QNE4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.17■■■■■ 4.18
Ccdc180J3QNE4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
Ccdc180J3QNE4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
Ccdc180J3QNE4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
Ccdc180J3QNE4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
Ccdc180J3QNE4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Ccdc180J3QNE4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Ccdc180J3QNE4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Ccdc180J3QNE4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Ccdc180J3QNE4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
Ccdc180J3QNE4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC41.13■■■■■ 4.17
Ccdc180J3QNE4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
Ccdc180J3QNE4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC41.12■■■■■ 4.17
Ccdc180J3QNE4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
Ccdc180J3QNE4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Ccdc180J3QNE4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Ccdc180J3QNE4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Ccdc180J3QNE4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
Ccdc180J3QNE4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Ccdc180J3QNE4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
Ccdc180J3QNE4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC41.1■■■■■ 4.17
Ccdc180J3QNE4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
Ccdc180J3QNE4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Ccdc180J3QNE4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Ccdc180J3QNE4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Ccdc180J3QNE4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Ccdc180J3QNE4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Ccdc180J3QNE4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC41.08■■■■■ 4.17
Ccdc180J3QNE4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
Ccdc180J3QNE4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
Ccdc180J3QNE4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
Ccdc180J3QNE4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
Ccdc180J3QNE4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC41.07■■■■■ 4.16
Ccdc180J3QNE4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
Ccdc180J3QNE4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.16
Ccdc180J3QNE4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
Ccdc180J3QNE4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Ccdc180J3QNE4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
Ccdc180J3QNE4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Ccdc180J3QNE4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Ccdc180J3QNE4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Ccdc180J3QNE4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Ccdc180J3QNE4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC41.03■■■■■ 4.16
Ccdc180J3QNE4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Ccdc180J3QNE4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Ccdc180J3QNE4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC41.02■■■■■ 4.16
Ccdc180J3QNE4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Ccdc180J3QNE4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.7 ms