Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3336J3QMQ6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3336J3QMQ6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3336J3QMQ6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3336J3QMQ6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3336J3QMQ6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3336J3QMQ6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3336J3QMQ6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3336J3QMQ6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3336J3QMQ6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3336J3QMQ6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3336J3QMQ6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3336J3QMQ6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3336J3QMQ6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3336J3QMQ6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3336J3QMQ6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3336J3QMQ6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3336J3QMQ6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3336J3QMQ6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3336J3QMQ6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3336J3QMQ6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3336J3QMQ6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3336J3QMQ6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3336J3QMQ6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3336J3QMQ6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3336J3QMQ6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3336J3QMQ6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm3336J3QMQ6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm3336J3QMQ6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3336J3QMQ6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3336J3QMQ6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3336J3QMQ6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3336J3QMQ6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3336J3QMQ6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3336J3QMQ6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3336J3QMQ6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3336J3QMQ6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3336J3QMQ6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3336J3QMQ6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3336J3QMQ6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3336J3QMQ6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3336J3QMQ6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3336J3QMQ6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3336J3QMQ6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3336J3QMQ6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3336J3QMQ6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3336J3QMQ6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3336J3QMQ6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3336J3QMQ6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3336J3QMQ6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3336J3QMQ6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3336J3QMQ6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3336J3QMQ6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3336J3QMQ6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3336J3QMQ6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3336J3QMQ6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm3336J3QMQ6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3336J3QMQ6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3336J3QMQ6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3336J3QMQ6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3336J3QMQ6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3336J3QMQ6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3336J3QMQ6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3336J3QMQ6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3336J3QMQ6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3336J3QMQ6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3336J3QMQ6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3336J3QMQ6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3336J3QMQ6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3336J3QMQ6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3336J3QMQ6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3336J3QMQ6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3336J3QMQ6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3336J3QMQ6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3336J3QMQ6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3336J3QMQ6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3336J3QMQ6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3336J3QMQ6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3336J3QMQ6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3336J3QMQ6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3336J3QMQ6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3336J3QMQ6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3336J3QMQ6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3336J3QMQ6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3336J3QMQ6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3336J3QMQ6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3336J3QMQ6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3336J3QMQ6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3336J3QMQ6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3336J3QMQ6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3336J3QMQ6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3336J3QMQ6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3336J3QMQ6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3336J3QMQ6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gm3336J3QMQ6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3336J3QMQ6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3336J3QMQ6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3336J3QMQ6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3336J3QMQ6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3336J3QMQ6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
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