Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn34c3J3QJW5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn34c3J3QJW5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn34c3J3QJW5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn34c3J3QJW5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn34c3J3QJW5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34c3J3QJW5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34c3J3QJW5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34c3J3QJW5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34c3J3QJW5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34c3J3QJW5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34c3J3QJW5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34c3J3QJW5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34c3J3QJW5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34c3J3QJW5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34c3J3QJW5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34c3J3QJW5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34c3J3QJW5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34c3J3QJW5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34c3J3QJW5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34c3J3QJW5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34c3J3QJW5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34c3J3QJW5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34c3J3QJW5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34c3J3QJW5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34c3J3QJW5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34c3J3QJW5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34c3J3QJW5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34c3J3QJW5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34c3J3QJW5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34c3J3QJW5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34c3J3QJW5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34c3J3QJW5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34c3J3QJW5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34c3J3QJW5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34c3J3QJW5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34c3J3QJW5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34c3J3QJW5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34c3J3QJW5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34c3J3QJW5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34c3J3QJW5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cldn34c3J3QJW5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34c3J3QJW5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34c3J3QJW5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34c3J3QJW5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34c3J3QJW5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34c3J3QJW5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34c3J3QJW5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34c3J3QJW5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34c3J3QJW5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34c3J3QJW5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34c3J3QJW5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn34c3J3QJW5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn34c3J3QJW5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn34c3J3QJW5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn34c3J3QJW5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn34c3J3QJW5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn34c3J3QJW5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn34c3J3QJW5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn34c3J3QJW5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn34c3J3QJW5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn34c3J3QJW5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn34c3J3QJW5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn34c3J3QJW5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn34c3J3QJW5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34c3J3QJW5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34c3J3QJW5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34c3J3QJW5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34c3J3QJW5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34c3J3QJW5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34c3J3QJW5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34c3J3QJW5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34c3J3QJW5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34c3J3QJW5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34c3J3QJW5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34c3J3QJW5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn34c3J3QJW5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn34c3J3QJW5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn34c3J3QJW5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn34c3J3QJW5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn34c3J3QJW5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn34c3J3QJW5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cldn34c3J3QJW5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn34c3J3QJW5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn34c3J3QJW5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn34c3J3QJW5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn34c3J3QJW5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn34c3J3QJW5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn34c3J3QJW5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn34c3J3QJW5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn34c3J3QJW5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn34c3J3QJW5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn34c3J3QJW5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn34c3J3QJW5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn34c3J3QJW5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn34c3J3QJW5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn34c3J3QJW5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn34c3J3QJW5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn34c3J3QJW5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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