Protein–RNA interactions for Protein: J3JS27

Vmn1r194, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r194J3JS27 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r194J3JS27 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r194J3JS27 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r194J3JS27 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r194J3JS27 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r194J3JS27 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r194J3JS27 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r194J3JS27 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r194J3JS27 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r194J3JS27 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r194J3JS27 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r194J3JS27 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r194J3JS27 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r194J3JS27 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r194J3JS27 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r194J3JS27 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r194J3JS27 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r194J3JS27 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r194J3JS27 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r194J3JS27 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r194J3JS27 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r194J3JS27 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r194J3JS27 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r194J3JS27 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r194J3JS27 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r194J3JS27 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r194J3JS27 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r194J3JS27 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r194J3JS27 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r194J3JS27 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r194J3JS27 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r194J3JS27 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r194J3JS27 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r194J3JS27 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r194J3JS27 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r194J3JS27 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r194J3JS27 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r194J3JS27 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r194J3JS27 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r194J3JS27 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r194J3JS27 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r194J3JS27 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r194J3JS27 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r194J3JS27 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r194J3JS27 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r194J3JS27 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r194J3JS27 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r194J3JS27 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r194J3JS27 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r194J3JS27 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r194J3JS27 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r194J3JS27 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r194J3JS27 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r194J3JS27 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r194J3JS27 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r194J3JS27 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r194J3JS27 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r194J3JS27 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r194J3JS27 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r194J3JS27 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r194J3JS27 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r194J3JS27 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r194J3JS27 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms