Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pabpc4lG5E8X2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pabpc4lG5E8X2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pabpc4lG5E8X2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc4lG5E8X2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc4lG5E8X2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc4lG5E8X2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc4lG5E8X2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc4lG5E8X2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc4lG5E8X2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpc4lG5E8X2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pabpc4lG5E8X2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pabpc4lG5E8X2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pabpc4lG5E8X2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pabpc4lG5E8X2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pabpc4lG5E8X2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pabpc4lG5E8X2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pabpc4lG5E8X2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pabpc4lG5E8X2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pabpc4lG5E8X2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pabpc4lG5E8X2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pabpc4lG5E8X2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pabpc4lG5E8X2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pabpc4lG5E8X2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pabpc4lG5E8X2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpc4lG5E8X2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpc4lG5E8X2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpc4lG5E8X2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpc4lG5E8X2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpc4lG5E8X2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpc4lG5E8X2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpc4lG5E8X2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpc4lG5E8X2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpc4lG5E8X2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpc4lG5E8X2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpc4lG5E8X2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpc4lG5E8X2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpc4lG5E8X2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpc4lG5E8X2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pabpc4lG5E8X2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pabpc4lG5E8X2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pabpc4lG5E8X2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pabpc4lG5E8X2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pabpc4lG5E8X2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pabpc4lG5E8X2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pabpc4lG5E8X2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pabpc4lG5E8X2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pabpc4lG5E8X2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pabpc4lG5E8X2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pabpc4lG5E8X2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pabpc4lG5E8X2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pabpc4lG5E8X2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pabpc4lG5E8X2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pabpc4lG5E8X2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pabpc4lG5E8X2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pabpc4lG5E8X2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pabpc4lG5E8X2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pabpc4lG5E8X2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pabpc4lG5E8X2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pabpc4lG5E8X2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pabpc4lG5E8X2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pabpc4lG5E8X2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pabpc4lG5E8X2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pabpc4lG5E8X2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pabpc4lG5E8X2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pabpc4lG5E8X2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pabpc4lG5E8X2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pabpc4lG5E8X2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pabpc4lG5E8X2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pabpc4lG5E8X2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pabpc4lG5E8X2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pabpc4lG5E8X2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pabpc4lG5E8X2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pabpc4lG5E8X2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pabpc4lG5E8X2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pabpc4lG5E8X2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pabpc4lG5E8X2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pabpc4lG5E8X2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pabpc4lG5E8X2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pabpc4lG5E8X2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pabpc4lG5E8X2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pabpc4lG5E8X2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pabpc4lG5E8X2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pabpc4lG5E8X2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pabpc4lG5E8X2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pabpc4lG5E8X2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pabpc4lG5E8X2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pabpc4lG5E8X2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pabpc4lG5E8X2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pabpc4lG5E8X2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pabpc4lG5E8X2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pabpc4lG5E8X2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pabpc4lG5E8X2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pabpc4lG5E8X2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pabpc4lG5E8X2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pabpc4lG5E8X2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pabpc4lG5E8X2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pabpc4lG5E8X2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pabpc4lG5E8X2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pabpc4lG5E8X2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms