Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nkx1-1G3UXB3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nkx1-1G3UXB3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nkx1-1G3UXB3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Nkx1-1G3UXB3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nkx1-1G3UXB3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nkx1-1G3UXB3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nkx1-1G3UXB3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nkx1-1G3UXB3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nkx1-1G3UXB3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nkx1-1G3UXB3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nkx1-1G3UXB3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nkx1-1G3UXB3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Nkx1-1G3UXB3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Nkx1-1G3UXB3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nkx1-1G3UXB3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Nkx1-1G3UXB3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nkx1-1G3UXB3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nkx1-1G3UXB3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nkx1-1G3UXB3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nkx1-1G3UXB3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nkx1-1G3UXB3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nkx1-1G3UXB3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nkx1-1G3UXB3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nkx1-1G3UXB3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nkx1-1G3UXB3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nkx1-1G3UXB3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nkx1-1G3UXB3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nkx1-1G3UXB3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nkx1-1G3UXB3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nkx1-1G3UXB3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Nkx1-1G3UXB3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nkx1-1G3UXB3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nkx1-1G3UXB3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nkx1-1G3UXB3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Nkx1-1G3UXB3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nkx1-1G3UXB3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nkx1-1G3UXB3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nkx1-1G3UXB3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nkx1-1G3UXB3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nkx1-1G3UXB3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nkx1-1G3UXB3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nkx1-1G3UXB3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nkx1-1G3UXB3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Nkx1-1G3UXB3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nkx1-1G3UXB3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nkx1-1G3UXB3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nkx1-1G3UXB3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nkx1-1G3UXB3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nkx1-1G3UXB3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nkx1-1G3UXB3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nkx1-1G3UXB3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nkx1-1G3UXB3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nkx1-1G3UXB3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nkx1-1G3UXB3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Nkx1-1G3UXB3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nkx1-1G3UXB3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Nkx1-1G3UXB3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nkx1-1G3UXB3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nkx1-1G3UXB3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nkx1-1G3UXB3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nkx1-1G3UXB3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nkx1-1G3UXB3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nkx1-1G3UXB3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nkx1-1G3UXB3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nkx1-1G3UXB3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nkx1-1G3UXB3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nkx1-1G3UXB3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nkx1-1G3UXB3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nkx1-1G3UXB3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nkx1-1G3UXB3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nkx1-1G3UXB3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nkx1-1G3UXB3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nkx1-1G3UXB3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nkx1-1G3UXB3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nkx1-1G3UXB3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nkx1-1G3UXB3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nkx1-1G3UXB3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nkx1-1G3UXB3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nkx1-1G3UXB3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nkx1-1G3UXB3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nkx1-1G3UXB3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nkx1-1G3UXB3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nkx1-1G3UXB3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nkx1-1G3UXB3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nkx1-1G3UXB3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nkx1-1G3UXB3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nkx1-1G3UXB3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nkx1-1G3UXB3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nkx1-1G3UXB3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nkx1-1G3UXB3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Nkx1-1G3UXB3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nkx1-1G3UXB3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Nkx1-1G3UXB3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nkx1-1G3UXB3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Nkx1-1G3UXB3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nkx1-1G3UXB3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 318.1 ms