Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp9yF8VPU6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp9yF8VPU6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp9yF8VPU6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp9yF8VPU6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp9yF8VPU6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp9yF8VPU6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp9yF8VPU6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp9yF8VPU6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp9yF8VPU6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp9yF8VPU6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp9yF8VPU6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp9yF8VPU6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp9yF8VPU6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp9yF8VPU6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp9yF8VPU6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp9yF8VPU6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp9yF8VPU6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp9yF8VPU6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp9yF8VPU6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp9yF8VPU6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp9yF8VPU6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp9yF8VPU6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp9yF8VPU6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp9yF8VPU6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp9yF8VPU6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp9yF8VPU6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp9yF8VPU6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp9yF8VPU6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp9yF8VPU6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp9yF8VPU6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp9yF8VPU6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp9yF8VPU6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp9yF8VPU6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp9yF8VPU6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp9yF8VPU6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp9yF8VPU6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp9yF8VPU6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp9yF8VPU6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp9yF8VPU6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp9yF8VPU6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp9yF8VPU6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp9yF8VPU6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp9yF8VPU6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp9yF8VPU6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp9yF8VPU6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp9yF8VPU6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp9yF8VPU6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp9yF8VPU6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp9yF8VPU6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp9yF8VPU6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp9yF8VPU6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp9yF8VPU6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp9yF8VPU6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp9yF8VPU6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp9yF8VPU6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp9yF8VPU6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp9yF8VPU6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp9yF8VPU6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp9yF8VPU6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp9yF8VPU6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp9yF8VPU6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp9yF8VPU6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp9yF8VPU6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp9yF8VPU6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp9yF8VPU6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp9yF8VPU6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp9yF8VPU6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp9yF8VPU6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp9yF8VPU6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp9yF8VPU6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp9yF8VPU6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp9yF8VPU6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp9yF8VPU6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp9yF8VPU6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp9yF8VPU6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp9yF8VPU6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp9yF8VPU6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp9yF8VPU6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp9yF8VPU6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp9yF8VPU6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp9yF8VPU6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp9yF8VPU6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp9yF8VPU6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp9yF8VPU6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp9yF8VPU6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp9yF8VPU6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp9yF8VPU6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp9yF8VPU6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp9yF8VPU6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp9yF8VPU6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp9yF8VPU6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp9yF8VPU6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp9yF8VPU6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp9yF8VPU6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp9yF8VPU6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp9yF8VPU6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp9yF8VPU6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp9yF8VPU6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp9yF8VPU6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms