Protein–RNA interactions for Protein: F8VPP8

Zc3h7b, Zinc finger CCCH type-containing 7B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h7bF8VPP8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zc3h7bF8VPP8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zc3h7bF8VPP8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zc3h7bF8VPP8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zc3h7bF8VPP8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zc3h7bF8VPP8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zc3h7bF8VPP8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zc3h7bF8VPP8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zc3h7bF8VPP8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zc3h7bF8VPP8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zc3h7bF8VPP8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zc3h7bF8VPP8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zc3h7bF8VPP8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zc3h7bF8VPP8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Zc3h7bF8VPP8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zc3h7bF8VPP8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Zc3h7bF8VPP8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zc3h7bF8VPP8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zc3h7bF8VPP8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zc3h7bF8VPP8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zc3h7bF8VPP8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zc3h7bF8VPP8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zc3h7bF8VPP8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zc3h7bF8VPP8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zc3h7bF8VPP8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zc3h7bF8VPP8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zc3h7bF8VPP8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zc3h7bF8VPP8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zc3h7bF8VPP8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zc3h7bF8VPP8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zc3h7bF8VPP8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zc3h7bF8VPP8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zc3h7bF8VPP8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zc3h7bF8VPP8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zc3h7bF8VPP8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zc3h7bF8VPP8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zc3h7bF8VPP8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zc3h7bF8VPP8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zc3h7bF8VPP8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zc3h7bF8VPP8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Zc3h7bF8VPP8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zc3h7bF8VPP8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zc3h7bF8VPP8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zc3h7bF8VPP8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zc3h7bF8VPP8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zc3h7bF8VPP8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zc3h7bF8VPP8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zc3h7bF8VPP8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zc3h7bF8VPP8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zc3h7bF8VPP8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zc3h7bF8VPP8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zc3h7bF8VPP8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Zc3h7bF8VPP8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Zc3h7bF8VPP8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zc3h7bF8VPP8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zc3h7bF8VPP8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zc3h7bF8VPP8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zc3h7bF8VPP8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zc3h7bF8VPP8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Zc3h7bF8VPP8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zc3h7bF8VPP8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zc3h7bF8VPP8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zc3h7bF8VPP8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zc3h7bF8VPP8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zc3h7bF8VPP8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zc3h7bF8VPP8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zc3h7bF8VPP8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zc3h7bF8VPP8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zc3h7bF8VPP8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Zc3h7bF8VPP8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zc3h7bF8VPP8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zc3h7bF8VPP8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zc3h7bF8VPP8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Zc3h7bF8VPP8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zc3h7bF8VPP8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zc3h7bF8VPP8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zc3h7bF8VPP8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zc3h7bF8VPP8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zc3h7bF8VPP8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Zc3h7bF8VPP8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Zc3h7bF8VPP8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zc3h7bF8VPP8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zc3h7bF8VPP8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zc3h7bF8VPP8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zc3h7bF8VPP8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zc3h7bF8VPP8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zc3h7bF8VPP8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zc3h7bF8VPP8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zc3h7bF8VPP8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zc3h7bF8VPP8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zc3h7bF8VPP8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zc3h7bF8VPP8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zc3h7bF8VPP8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zc3h7bF8VPP8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zc3h7bF8VPP8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zc3h7bF8VPP8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zc3h7bF8VPP8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zc3h7bF8VPP8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zc3h7bF8VPP8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zc3h7bF8VPP8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms