Protein–RNA interactions for Protein: F7BE84

Ankrd50, Ankyrin repeat domain 50 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd50F7BE84 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ankrd50F7BE84 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ankrd50F7BE84 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ankrd50F7BE84 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ankrd50F7BE84 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ankrd50F7BE84 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ankrd50F7BE84 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ankrd50F7BE84 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ankrd50F7BE84 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ankrd50F7BE84 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ankrd50F7BE84 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Ankrd50F7BE84 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ankrd50F7BE84 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Ankrd50F7BE84 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ankrd50F7BE84 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ankrd50F7BE84 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Ankrd50F7BE84 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ankrd50F7BE84 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ankrd50F7BE84 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ankrd50F7BE84 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ankrd50F7BE84 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ankrd50F7BE84 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ankrd50F7BE84 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Ankrd50F7BE84 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ankrd50F7BE84 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ankrd50F7BE84 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Ankrd50F7BE84 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ankrd50F7BE84 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ankrd50F7BE84 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ankrd50F7BE84 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ankrd50F7BE84 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ankrd50F7BE84 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ankrd50F7BE84 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ankrd50F7BE84 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ankrd50F7BE84 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ankrd50F7BE84 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ankrd50F7BE84 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ankrd50F7BE84 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ankrd50F7BE84 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ankrd50F7BE84 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ankrd50F7BE84 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ankrd50F7BE84 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ankrd50F7BE84 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ankrd50F7BE84 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ankrd50F7BE84 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ankrd50F7BE84 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ankrd50F7BE84 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ankrd50F7BE84 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ankrd50F7BE84 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ankrd50F7BE84 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Ankrd50F7BE84 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ankrd50F7BE84 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ankrd50F7BE84 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ankrd50F7BE84 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ankrd50F7BE84 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ankrd50F7BE84 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ankrd50F7BE84 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ankrd50F7BE84 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ankrd50F7BE84 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ankrd50F7BE84 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ankrd50F7BE84 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ankrd50F7BE84 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ankrd50F7BE84 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ankrd50F7BE84 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Ankrd50F7BE84 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ankrd50F7BE84 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ankrd50F7BE84 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ankrd50F7BE84 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ankrd50F7BE84 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ankrd50F7BE84 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ankrd50F7BE84 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ankrd50F7BE84 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ankrd50F7BE84 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ankrd50F7BE84 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ankrd50F7BE84 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ankrd50F7BE84 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ankrd50F7BE84 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ankrd50F7BE84 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ankrd50F7BE84 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ankrd50F7BE84 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ankrd50F7BE84 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ankrd50F7BE84 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ankrd50F7BE84 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ankrd50F7BE84 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ankrd50F7BE84 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ankrd50F7BE84 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ankrd50F7BE84 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ankrd50F7BE84 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ankrd50F7BE84 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ankrd50F7BE84 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ankrd50F7BE84 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ankrd50F7BE84 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ankrd50F7BE84 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ankrd50F7BE84 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ankrd50F7BE84 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ankrd50F7BE84 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ankrd50F7BE84 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ankrd50F7BE84 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ankrd50F7BE84 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Ankrd50F7BE84 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms