Protein–RNA interactions for Protein: F7AEC7

Gm2832, Predicted gene 2832 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2832F7AEC7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm2832F7AEC7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm2832F7AEC7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm2832F7AEC7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm2832F7AEC7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm2832F7AEC7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm2832F7AEC7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm2832F7AEC7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm2832F7AEC7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm2832F7AEC7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm2832F7AEC7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm2832F7AEC7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm2832F7AEC7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm2832F7AEC7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm2832F7AEC7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm2832F7AEC7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm2832F7AEC7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm2832F7AEC7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm2832F7AEC7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm2832F7AEC7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm2832F7AEC7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm2832F7AEC7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm2832F7AEC7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm2832F7AEC7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm2832F7AEC7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2832F7AEC7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2832F7AEC7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2832F7AEC7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2832F7AEC7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2832F7AEC7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2832F7AEC7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm2832F7AEC7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm2832F7AEC7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm2832F7AEC7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm2832F7AEC7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm2832F7AEC7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm2832F7AEC7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm2832F7AEC7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm2832F7AEC7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm2832F7AEC7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm2832F7AEC7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm2832F7AEC7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm2832F7AEC7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm2832F7AEC7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gm2832F7AEC7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm2832F7AEC7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm2832F7AEC7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm2832F7AEC7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm2832F7AEC7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm2832F7AEC7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm2832F7AEC7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm2832F7AEC7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm2832F7AEC7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm2832F7AEC7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm2832F7AEC7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm2832F7AEC7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm2832F7AEC7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm2832F7AEC7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm2832F7AEC7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm2832F7AEC7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm2832F7AEC7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm2832F7AEC7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm2832F7AEC7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm2832F7AEC7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm2832F7AEC7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm2832F7AEC7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm2832F7AEC7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm2832F7AEC7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm2832F7AEC7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm2832F7AEC7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm2832F7AEC7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm2832F7AEC7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm2832F7AEC7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm2832F7AEC7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm2832F7AEC7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm2832F7AEC7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm2832F7AEC7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm2832F7AEC7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm2832F7AEC7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm2832F7AEC7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm2832F7AEC7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm2832F7AEC7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm2832F7AEC7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm2832F7AEC7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm2832F7AEC7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm2832F7AEC7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm2832F7AEC7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gm2832F7AEC7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm2832F7AEC7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm2832F7AEC7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm2832F7AEC7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm2832F7AEC7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm2832F7AEC7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm2832F7AEC7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm2832F7AEC7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm2832F7AEC7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm2832F7AEC7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm2832F7AEC7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm2832F7AEC7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm2832F7AEC7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.9 ms