Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm8247F6VRJ8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm8247F6VRJ8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm8247F6VRJ8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm8247F6VRJ8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm8247F6VRJ8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm8247F6VRJ8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm8247F6VRJ8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm8247F6VRJ8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm8247F6VRJ8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm8247F6VRJ8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm8247F6VRJ8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm8247F6VRJ8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm8247F6VRJ8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm8247F6VRJ8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm8247F6VRJ8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm8247F6VRJ8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm8247F6VRJ8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm8247F6VRJ8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm8247F6VRJ8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm8247F6VRJ8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm8247F6VRJ8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm8247F6VRJ8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm8247F6VRJ8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm8247F6VRJ8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm8247F6VRJ8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm8247F6VRJ8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm8247F6VRJ8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm8247F6VRJ8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm8247F6VRJ8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm8247F6VRJ8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm8247F6VRJ8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm8247F6VRJ8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm8247F6VRJ8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm8247F6VRJ8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm8247F6VRJ8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm8247F6VRJ8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm8247F6VRJ8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm8247F6VRJ8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm8247F6VRJ8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm8247F6VRJ8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm8247F6VRJ8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm8247F6VRJ8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm8247F6VRJ8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm8247F6VRJ8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm8247F6VRJ8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm8247F6VRJ8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm8247F6VRJ8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm8247F6VRJ8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm8247F6VRJ8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm8247F6VRJ8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm8247F6VRJ8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm8247F6VRJ8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm8247F6VRJ8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm8247F6VRJ8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm8247F6VRJ8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm8247F6VRJ8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm8247F6VRJ8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm8247F6VRJ8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm8247F6VRJ8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm8247F6VRJ8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm8247F6VRJ8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm8247F6VRJ8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm8247F6VRJ8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm8247F6VRJ8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm8247F6VRJ8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm8247F6VRJ8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm8247F6VRJ8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm8247F6VRJ8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm8247F6VRJ8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm8247F6VRJ8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm8247F6VRJ8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm8247F6VRJ8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm8247F6VRJ8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm8247F6VRJ8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm8247F6VRJ8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm8247F6VRJ8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm8247F6VRJ8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm8247F6VRJ8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm8247F6VRJ8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm8247F6VRJ8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm8247F6VRJ8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm8247F6VRJ8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm8247F6VRJ8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm8247F6VRJ8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm8247F6VRJ8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm8247F6VRJ8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm8247F6VRJ8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm8247F6VRJ8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm8247F6VRJ8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm8247F6VRJ8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm8247F6VRJ8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm8247F6VRJ8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm8247F6VRJ8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm8247F6VRJ8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm8247F6VRJ8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm8247F6VRJ8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm8247F6VRJ8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm8247F6VRJ8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm8247F6VRJ8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms