Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm21977F6U3N7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm21977F6U3N7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm21977F6U3N7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm21977F6U3N7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm21977F6U3N7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm21977F6U3N7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm21977F6U3N7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm21977F6U3N7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm21977F6U3N7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm21977F6U3N7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm21977F6U3N7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm21977F6U3N7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm21977F6U3N7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm21977F6U3N7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm21977F6U3N7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm21977F6U3N7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm21977F6U3N7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm21977F6U3N7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm21977F6U3N7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm21977F6U3N7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm21977F6U3N7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm21977F6U3N7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm21977F6U3N7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm21977F6U3N7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm21977F6U3N7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm21977F6U3N7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm21977F6U3N7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm21977F6U3N7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm21977F6U3N7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm21977F6U3N7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm21977F6U3N7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm21977F6U3N7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm21977F6U3N7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm21977F6U3N7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm21977F6U3N7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm21977F6U3N7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm21977F6U3N7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm21977F6U3N7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm21977F6U3N7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm21977F6U3N7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm21977F6U3N7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm21977F6U3N7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm21977F6U3N7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm21977F6U3N7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm21977F6U3N7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm21977F6U3N7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm21977F6U3N7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm21977F6U3N7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm21977F6U3N7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm21977F6U3N7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm21977F6U3N7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm21977F6U3N7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm21977F6U3N7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm21977F6U3N7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm21977F6U3N7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm21977F6U3N7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm21977F6U3N7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm21977F6U3N7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm21977F6U3N7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm21977F6U3N7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm21977F6U3N7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm21977F6U3N7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm21977F6U3N7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm21977F6U3N7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm21977F6U3N7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm21977F6U3N7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm21977F6U3N7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm21977F6U3N7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm21977F6U3N7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm21977F6U3N7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm21977F6U3N7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm21977F6U3N7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm21977F6U3N7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm21977F6U3N7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm21977F6U3N7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm21977F6U3N7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm21977F6U3N7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm21977F6U3N7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm21977F6U3N7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm21977F6U3N7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm21977F6U3N7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm21977F6U3N7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm21977F6U3N7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm21977F6U3N7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm21977F6U3N7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm21977F6U3N7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm21977F6U3N7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm21977F6U3N7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm21977F6U3N7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm21977F6U3N7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm21977F6U3N7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm21977F6U3N7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm21977F6U3N7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm21977F6U3N7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm21977F6U3N7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm21977F6U3N7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21977F6U3N7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21977F6U3N7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21977F6U3N7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms