Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf212F6TQD1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf212F6TQD1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf212F6TQD1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf212F6TQD1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf212F6TQD1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf212F6TQD1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf212F6TQD1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf212F6TQD1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf212F6TQD1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf212F6TQD1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf212F6TQD1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf212F6TQD1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf212F6TQD1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf212F6TQD1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf212F6TQD1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf212F6TQD1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf212F6TQD1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf212F6TQD1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf212F6TQD1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf212F6TQD1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf212F6TQD1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf212F6TQD1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf212F6TQD1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnf212F6TQD1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnf212F6TQD1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf212F6TQD1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf212F6TQD1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf212F6TQD1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf212F6TQD1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf212F6TQD1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf212F6TQD1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf212F6TQD1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf212F6TQD1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf212F6TQD1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf212F6TQD1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf212F6TQD1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf212F6TQD1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf212F6TQD1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf212F6TQD1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf212F6TQD1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf212F6TQD1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf212F6TQD1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf212F6TQD1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf212F6TQD1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf212F6TQD1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf212F6TQD1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf212F6TQD1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf212F6TQD1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf212F6TQD1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf212F6TQD1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf212F6TQD1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf212F6TQD1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf212F6TQD1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf212F6TQD1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf212F6TQD1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf212F6TQD1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf212F6TQD1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf212F6TQD1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf212F6TQD1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf212F6TQD1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rnf212F6TQD1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rnf212F6TQD1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rnf212F6TQD1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf212F6TQD1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf212F6TQD1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf212F6TQD1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf212F6TQD1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf212F6TQD1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf212F6TQD1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf212F6TQD1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf212F6TQD1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf212F6TQD1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf212F6TQD1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf212F6TQD1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf212F6TQD1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf212F6TQD1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf212F6TQD1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf212F6TQD1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf212F6TQD1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf212F6TQD1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf212F6TQD1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf212F6TQD1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf212F6TQD1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf212F6TQD1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf212F6TQD1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf212F6TQD1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf212F6TQD1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf212F6TQD1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf212F6TQD1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf212F6TQD1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf212F6TQD1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf212F6TQD1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf212F6TQD1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf212F6TQD1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf212F6TQD1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf212F6TQD1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf212F6TQD1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf212F6TQD1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf212F6TQD1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms