Protein–RNA interactions for Protein: F6RSK3

Gm17430, Predicted gene, 17430, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17430F6RSK3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17430F6RSK3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17430F6RSK3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17430F6RSK3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17430F6RSK3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17430F6RSK3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17430F6RSK3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17430F6RSK3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17430F6RSK3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17430F6RSK3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17430F6RSK3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17430F6RSK3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17430F6RSK3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17430F6RSK3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17430F6RSK3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17430F6RSK3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17430F6RSK3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17430F6RSK3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17430F6RSK3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17430F6RSK3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17430F6RSK3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17430F6RSK3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17430F6RSK3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17430F6RSK3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17430F6RSK3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17430F6RSK3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17430F6RSK3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17430F6RSK3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17430F6RSK3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17430F6RSK3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17430F6RSK3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17430F6RSK3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17430F6RSK3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17430F6RSK3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17430F6RSK3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17430F6RSK3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17430F6RSK3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17430F6RSK3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17430F6RSK3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17430F6RSK3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17430F6RSK3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17430F6RSK3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17430F6RSK3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17430F6RSK3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17430F6RSK3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17430F6RSK3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17430F6RSK3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17430F6RSK3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17430F6RSK3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.9 ms