Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Cald1E9QA15 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cald1E9QA15 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cald1E9QA15 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cald1E9QA15 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cald1E9QA15 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cald1E9QA15 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cald1E9QA15 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cald1E9QA15 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Cald1E9QA15 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cald1E9QA15 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cald1E9QA15 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cald1E9QA15 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cald1E9QA15 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cald1E9QA15 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cald1E9QA15 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cald1E9QA15 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cald1E9QA15 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cald1E9QA15 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cald1E9QA15 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cald1E9QA15 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cald1E9QA15 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cald1E9QA15 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cald1E9QA15 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cald1E9QA15 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cald1E9QA15 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cald1E9QA15 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cald1E9QA15 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cald1E9QA15 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cald1E9QA15 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cald1E9QA15 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cald1E9QA15 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cald1E9QA15 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cald1E9QA15 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cald1E9QA15 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cald1E9QA15 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cald1E9QA15 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cald1E9QA15 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cald1E9QA15 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cald1E9QA15 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cald1E9QA15 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cald1E9QA15 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cald1E9QA15 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Cald1E9QA15 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cald1E9QA15 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cald1E9QA15 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cald1E9QA15 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Cald1E9QA15 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cald1E9QA15 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cald1E9QA15 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cald1E9QA15 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cald1E9QA15 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cald1E9QA15 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cald1E9QA15 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cald1E9QA15 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cald1E9QA15 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cald1E9QA15 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cald1E9QA15 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cald1E9QA15 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cald1E9QA15 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cald1E9QA15 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cald1E9QA15 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cald1E9QA15 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cald1E9QA15 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cald1E9QA15 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cald1E9QA15 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cald1E9QA15 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cald1E9QA15 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cald1E9QA15 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cald1E9QA15 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cald1E9QA15 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cald1E9QA15 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Cald1E9QA15 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cald1E9QA15 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cald1E9QA15 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cald1E9QA15 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cald1E9QA15 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Cald1E9QA15 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cald1E9QA15 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cald1E9QA15 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cald1E9QA15 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cald1E9QA15 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cald1E9QA15 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cald1E9QA15 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cald1E9QA15 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cald1E9QA15 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cald1E9QA15 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cald1E9QA15 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cald1E9QA15 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cald1E9QA15 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cald1E9QA15 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cald1E9QA15 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Cald1E9QA15 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cald1E9QA15 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cald1E9QA15 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Cald1E9QA15 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cald1E9QA15 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cald1E9QA15 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cald1E9QA15 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cald1E9QA15 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms